Protein–RNA interactions for Protein: Q3TWW8

Srsf6, Serine/arginine-rich splicing factor 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srsf6Q3TWW8 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Srsf6Q3TWW8 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Srsf6Q3TWW8 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Srsf6Q3TWW8 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Srsf6Q3TWW8 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Srsf6Q3TWW8 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Srsf6Q3TWW8 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Srsf6Q3TWW8 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Srsf6Q3TWW8 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Srsf6Q3TWW8 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Srsf6Q3TWW8 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Srsf6Q3TWW8 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Srsf6Q3TWW8 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Srsf6Q3TWW8 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Srsf6Q3TWW8 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Srsf6Q3TWW8 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Srsf6Q3TWW8 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Srsf6Q3TWW8 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Srsf6Q3TWW8 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Srsf6Q3TWW8 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Srsf6Q3TWW8 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Srsf6Q3TWW8 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Srsf6Q3TWW8 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Srsf6Q3TWW8 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Srsf6Q3TWW8 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Srsf6Q3TWW8 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Srsf6Q3TWW8 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Srsf6Q3TWW8 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Srsf6Q3TWW8 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Srsf6Q3TWW8 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Srsf6Q3TWW8 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Srsf6Q3TWW8 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Srsf6Q3TWW8 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Srsf6Q3TWW8 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Srsf6Q3TWW8 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Srsf6Q3TWW8 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Srsf6Q3TWW8 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Srsf6Q3TWW8 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Srsf6Q3TWW8 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Srsf6Q3TWW8 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Srsf6Q3TWW8 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Srsf6Q3TWW8 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Srsf6Q3TWW8 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Srsf6Q3TWW8 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Srsf6Q3TWW8 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Srsf6Q3TWW8 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Srsf6Q3TWW8 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Srsf6Q3TWW8 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Srsf6Q3TWW8 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Srsf6Q3TWW8 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Srsf6Q3TWW8 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Srsf6Q3TWW8 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Srsf6Q3TWW8 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Srsf6Q3TWW8 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Srsf6Q3TWW8 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Srsf6Q3TWW8 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Srsf6Q3TWW8 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Srsf6Q3TWW8 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Srsf6Q3TWW8 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Srsf6Q3TWW8 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Srsf6Q3TWW8 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Srsf6Q3TWW8 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Srsf6Q3TWW8 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Srsf6Q3TWW8 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Srsf6Q3TWW8 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Srsf6Q3TWW8 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Srsf6Q3TWW8 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Srsf6Q3TWW8 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Srsf6Q3TWW8 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Srsf6Q3TWW8 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Srsf6Q3TWW8 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Srsf6Q3TWW8 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Srsf6Q3TWW8 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Srsf6Q3TWW8 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Srsf6Q3TWW8 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Srsf6Q3TWW8 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Srsf6Q3TWW8 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Srsf6Q3TWW8 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Srsf6Q3TWW8 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Srsf6Q3TWW8 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Srsf6Q3TWW8 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Srsf6Q3TWW8 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Srsf6Q3TWW8 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Srsf6Q3TWW8 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Srsf6Q3TWW8 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Srsf6Q3TWW8 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Srsf6Q3TWW8 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Srsf6Q3TWW8 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Srsf6Q3TWW8 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Srsf6Q3TWW8 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Srsf6Q3TWW8 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Srsf6Q3TWW8 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Srsf6Q3TWW8 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Srsf6Q3TWW8 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Srsf6Q3TWW8 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Srsf6Q3TWW8 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Srsf6Q3TWW8 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Srsf6Q3TWW8 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Srsf6Q3TWW8 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Srsf6Q3TWW8 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms