Protein–RNA interactions for Protein: Q3TTJ4

Uncharacterized protein C8orf48 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 293 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3TTJ4 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Q3TTJ4 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Q3TTJ4 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Q3TTJ4 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Q3TTJ4 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Q3TTJ4 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Q3TTJ4 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Q3TTJ4 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Q3TTJ4 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Q3TTJ4 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Q3TTJ4 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Q3TTJ4 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Q3TTJ4 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Q3TTJ4 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Q3TTJ4 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Q3TTJ4 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Q3TTJ4 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Q3TTJ4 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Q3TTJ4 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Q3TTJ4 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Q3TTJ4 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Q3TTJ4 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Q3TTJ4 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Q3TTJ4 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Q3TTJ4 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Q3TTJ4 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Q3TTJ4 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Q3TTJ4 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Q3TTJ4 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Q3TTJ4 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Q3TTJ4 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Q3TTJ4 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Q3TTJ4 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Q3TTJ4 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Q3TTJ4 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Q3TTJ4 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Q3TTJ4 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Q3TTJ4 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Q3TTJ4 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Q3TTJ4 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Q3TTJ4 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Q3TTJ4 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Q3TTJ4 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Q3TTJ4 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Q3TTJ4 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Q3TTJ4 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Q3TTJ4 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Q3TTJ4 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Q3TTJ4 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Q3TTJ4 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Q3TTJ4 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Q3TTJ4 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Q3TTJ4 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Q3TTJ4 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Q3TTJ4 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Q3TTJ4 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Q3TTJ4 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Q3TTJ4 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Q3TTJ4 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Q3TTJ4 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Q3TTJ4 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Q3TTJ4 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Q3TTJ4 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Q3TTJ4 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Q3TTJ4 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Q3TTJ4 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Q3TTJ4 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Q3TTJ4 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Q3TTJ4 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Q3TTJ4 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Q3TTJ4 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Q3TTJ4 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Q3TTJ4 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Q3TTJ4 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Q3TTJ4 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Q3TTJ4 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Q3TTJ4 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Q3TTJ4 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Q3TTJ4 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Q3TTJ4 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Q3TTJ4 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Q3TTJ4 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Q3TTJ4 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Q3TTJ4 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Q3TTJ4 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Q3TTJ4 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Q3TTJ4 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Q3TTJ4 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Q3TTJ4 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Q3TTJ4 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Q3TTJ4 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Q3TTJ4 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Q3TTJ4 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Q3TTJ4 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Q3TTJ4 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Q3TTJ4 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Q3TTJ4 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Q3TTJ4 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Q3TTJ4 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Q3TTJ4 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms