Protein–RNA interactions for Protein: Q3TQZ4

Gm2016, Predicted gene 2016, mousemouse

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Length 144 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2016Q3TQZ4 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm2016Q3TQZ4 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm2016Q3TQZ4 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm2016Q3TQZ4 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm2016Q3TQZ4 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm2016Q3TQZ4 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm2016Q3TQZ4 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm2016Q3TQZ4 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm2016Q3TQZ4 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm2016Q3TQZ4 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm2016Q3TQZ4 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm2016Q3TQZ4 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm2016Q3TQZ4 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm2016Q3TQZ4 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm2016Q3TQZ4 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm2016Q3TQZ4 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm2016Q3TQZ4 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm2016Q3TQZ4 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm2016Q3TQZ4 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm2016Q3TQZ4 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm2016Q3TQZ4 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm2016Q3TQZ4 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm2016Q3TQZ4 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm2016Q3TQZ4 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm2016Q3TQZ4 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm2016Q3TQZ4 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
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Gm2016Q3TQZ4 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm2016Q3TQZ4 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm2016Q3TQZ4 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm2016Q3TQZ4 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm2016Q3TQZ4 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm2016Q3TQZ4 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm2016Q3TQZ4 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm2016Q3TQZ4 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm2016Q3TQZ4 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm2016Q3TQZ4 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm2016Q3TQZ4 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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Gm2016Q3TQZ4 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm2016Q3TQZ4 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm2016Q3TQZ4 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm2016Q3TQZ4 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm2016Q3TQZ4 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm2016Q3TQZ4 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm2016Q3TQZ4 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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Gm2016Q3TQZ4 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm2016Q3TQZ4 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm2016Q3TQZ4 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm2016Q3TQZ4 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm2016Q3TQZ4 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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Gm2016Q3TQZ4 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
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Gm2016Q3TQZ4 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm2016Q3TQZ4 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm2016Q3TQZ4 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm2016Q3TQZ4 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm2016Q3TQZ4 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm2016Q3TQZ4 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm2016Q3TQZ4 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm2016Q3TQZ4 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm2016Q3TQZ4 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm2016Q3TQZ4 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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Gm2016Q3TQZ4 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm2016Q3TQZ4 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm2016Q3TQZ4 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm2016Q3TQZ4 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm2016Q3TQZ4 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm2016Q3TQZ4 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm2016Q3TQZ4 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm2016Q3TQZ4 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm2016Q3TQZ4 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm2016Q3TQZ4 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm2016Q3TQZ4 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm2016Q3TQZ4 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm2016Q3TQZ4 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm2016Q3TQZ4 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm2016Q3TQZ4 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm2016Q3TQZ4 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm2016Q3TQZ4 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm2016Q3TQZ4 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm2016Q3TQZ4 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm2016Q3TQZ4 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm2016Q3TQZ4 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm2016Q3TQZ4 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm2016Q3TQZ4 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms