Protein–RNA interactions for Protein: Q3TP92

Ctdnep1, CTD nuclear envelope phosphatase 1, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdnep1Q3TP92 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ctdnep1Q3TP92 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ctdnep1Q3TP92 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ctdnep1Q3TP92 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ctdnep1Q3TP92 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ctdnep1Q3TP92 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ctdnep1Q3TP92 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ctdnep1Q3TP92 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ctdnep1Q3TP92 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ctdnep1Q3TP92 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ctdnep1Q3TP92 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ctdnep1Q3TP92 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ctdnep1Q3TP92 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Ctdnep1Q3TP92 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ctdnep1Q3TP92 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ctdnep1Q3TP92 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ctdnep1Q3TP92 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ctdnep1Q3TP92 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ctdnep1Q3TP92 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ctdnep1Q3TP92 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ctdnep1Q3TP92 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ctdnep1Q3TP92 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ctdnep1Q3TP92 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ctdnep1Q3TP92 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ctdnep1Q3TP92 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ctdnep1Q3TP92 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ctdnep1Q3TP92 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ctdnep1Q3TP92 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Ctdnep1Q3TP92 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ctdnep1Q3TP92 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ctdnep1Q3TP92 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ctdnep1Q3TP92 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ctdnep1Q3TP92 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ctdnep1Q3TP92 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ctdnep1Q3TP92 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ctdnep1Q3TP92 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ctdnep1Q3TP92 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ctdnep1Q3TP92 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ctdnep1Q3TP92 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ctdnep1Q3TP92 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ctdnep1Q3TP92 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ctdnep1Q3TP92 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ctdnep1Q3TP92 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ctdnep1Q3TP92 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ctdnep1Q3TP92 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ctdnep1Q3TP92 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ctdnep1Q3TP92 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Ctdnep1Q3TP92 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ctdnep1Q3TP92 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ctdnep1Q3TP92 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ctdnep1Q3TP92 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ctdnep1Q3TP92 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ctdnep1Q3TP92 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ctdnep1Q3TP92 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ctdnep1Q3TP92 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ctdnep1Q3TP92 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ctdnep1Q3TP92 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ctdnep1Q3TP92 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ctdnep1Q3TP92 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ctdnep1Q3TP92 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ctdnep1Q3TP92 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ctdnep1Q3TP92 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ctdnep1Q3TP92 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Ctdnep1Q3TP92 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ctdnep1Q3TP92 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ctdnep1Q3TP92 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ctdnep1Q3TP92 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Ctdnep1Q3TP92 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ctdnep1Q3TP92 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ctdnep1Q3TP92 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ctdnep1Q3TP92 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ctdnep1Q3TP92 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ctdnep1Q3TP92 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ctdnep1Q3TP92 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ctdnep1Q3TP92 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ctdnep1Q3TP92 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ctdnep1Q3TP92 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ctdnep1Q3TP92 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ctdnep1Q3TP92 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ctdnep1Q3TP92 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ctdnep1Q3TP92 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ctdnep1Q3TP92 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ctdnep1Q3TP92 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ctdnep1Q3TP92 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ctdnep1Q3TP92 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ctdnep1Q3TP92 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ctdnep1Q3TP92 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ctdnep1Q3TP92 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Ctdnep1Q3TP92 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ctdnep1Q3TP92 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ctdnep1Q3TP92 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ctdnep1Q3TP92 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ctdnep1Q3TP92 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ctdnep1Q3TP92 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ctdnep1Q3TP92 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ctdnep1Q3TP92 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Ctdnep1Q3TP92 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ctdnep1Q3TP92 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ctdnep1Q3TP92 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ctdnep1Q3TP92 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms