Protein–RNA interactions for Protein: Q3TLI0

Trappc10, Trafficking protein particle complex subunit 10, mousemouse

Predictions only

Length 1,259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc10Q3TLI0 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.74
Trappc10Q3TLI0 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Trappc10Q3TLI0 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Trappc10Q3TLI0 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Trappc10Q3TLI0 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Trappc10Q3TLI0 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Trappc10Q3TLI0 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Trappc10Q3TLI0 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Trappc10Q3TLI0 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Trappc10Q3TLI0 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Trappc10Q3TLI0 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Trappc10Q3TLI0 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Trappc10Q3TLI0 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Trappc10Q3TLI0 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Trappc10Q3TLI0 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Trappc10Q3TLI0 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Trappc10Q3TLI0 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Trappc10Q3TLI0 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Trappc10Q3TLI0 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
Trappc10Q3TLI0 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Trappc10Q3TLI0 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Trappc10Q3TLI0 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Trappc10Q3TLI0 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
Trappc10Q3TLI0 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Trappc10Q3TLI0 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Trappc10Q3TLI0 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Trappc10Q3TLI0 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Trappc10Q3TLI0 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Trappc10Q3TLI0 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Trappc10Q3TLI0 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Trappc10Q3TLI0 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Trappc10Q3TLI0 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Trappc10Q3TLI0 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Trappc10Q3TLI0 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Trappc10Q3TLI0 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Trappc10Q3TLI0 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Trappc10Q3TLI0 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Trappc10Q3TLI0 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Trappc10Q3TLI0 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Trappc10Q3TLI0 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
Trappc10Q3TLI0 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Trappc10Q3TLI0 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Trappc10Q3TLI0 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Trappc10Q3TLI0 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Trappc10Q3TLI0 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Trappc10Q3TLI0 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
Trappc10Q3TLI0 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Trappc10Q3TLI0 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Trappc10Q3TLI0 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Trappc10Q3TLI0 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Trappc10Q3TLI0 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Trappc10Q3TLI0 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Trappc10Q3TLI0 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Trappc10Q3TLI0 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Trappc10Q3TLI0 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Trappc10Q3TLI0 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Trappc10Q3TLI0 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Trappc10Q3TLI0 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Trappc10Q3TLI0 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Trappc10Q3TLI0 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Trappc10Q3TLI0 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Trappc10Q3TLI0 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Trappc10Q3TLI0 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Trappc10Q3TLI0 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Trappc10Q3TLI0 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Trappc10Q3TLI0 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Trappc10Q3TLI0 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Trappc10Q3TLI0 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Trappc10Q3TLI0 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Trappc10Q3TLI0 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Trappc10Q3TLI0 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Trappc10Q3TLI0 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Trappc10Q3TLI0 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Trappc10Q3TLI0 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Trappc10Q3TLI0 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Trappc10Q3TLI0 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Trappc10Q3TLI0 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Trappc10Q3TLI0 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Trappc10Q3TLI0 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Trappc10Q3TLI0 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Trappc10Q3TLI0 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Trappc10Q3TLI0 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Trappc10Q3TLI0 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Trappc10Q3TLI0 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Trappc10Q3TLI0 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Trappc10Q3TLI0 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Trappc10Q3TLI0 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Trappc10Q3TLI0 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Trappc10Q3TLI0 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Trappc10Q3TLI0 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Trappc10Q3TLI0 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Trappc10Q3TLI0 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Trappc10Q3TLI0 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Trappc10Q3TLI0 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Trappc10Q3TLI0 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Trappc10Q3TLI0 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Trappc10Q3TLI0 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Trappc10Q3TLI0 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Trappc10Q3TLI0 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Trappc10Q3TLI0 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms