Protein–RNA interactions for Protein: Q3TKT4

Smarca4, Transcription activator BRG1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarca4Q3TKT4 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC30.14■■■□□ 2.42
Smarca4Q3TKT4 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
Smarca4Q3TKT4 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
Smarca4Q3TKT4 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.14■■■□□ 2.42
Smarca4Q3TKT4 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
Smarca4Q3TKT4 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
Smarca4Q3TKT4 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
Smarca4Q3TKT4 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
Smarca4Q3TKT4 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC30.14■■■□□ 2.42
Smarca4Q3TKT4 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC30.14■■■□□ 2.42
Smarca4Q3TKT4 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC30.14■■■□□ 2.42
Smarca4Q3TKT4 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.14■■■□□ 2.42
Smarca4Q3TKT4 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC30.14■■■□□ 2.41
Smarca4Q3TKT4 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.41
Smarca4Q3TKT4 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.41
Smarca4Q3TKT4 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.41
Smarca4Q3TKT4 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC30.14■■■□□ 2.41
Smarca4Q3TKT4 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.41
Smarca4Q3TKT4 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
Smarca4Q3TKT4 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
Smarca4Q3TKT4 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
Smarca4Q3TKT4 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
Smarca4Q3TKT4 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.13■■■□□ 2.41
Smarca4Q3TKT4 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
Smarca4Q3TKT4 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
Smarca4Q3TKT4 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC30.13■■■□□ 2.41
Smarca4Q3TKT4 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
Smarca4Q3TKT4 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC30.12■■■□□ 2.41
Smarca4Q3TKT4 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Smarca4Q3TKT4 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Smarca4Q3TKT4 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC30.12■■■□□ 2.41
Smarca4Q3TKT4 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Smarca4Q3TKT4 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Smarca4Q3TKT4 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Smarca4Q3TKT4 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Smarca4Q3TKT4 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC30.12■■■□□ 2.41
Smarca4Q3TKT4 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Smarca4Q3TKT4 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Smarca4Q3TKT4 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.12■■■□□ 2.41
Smarca4Q3TKT4 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Smarca4Q3TKT4 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC30.11■■■□□ 2.41
Smarca4Q3TKT4 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Smarca4Q3TKT4 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Smarca4Q3TKT4 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Smarca4Q3TKT4 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Smarca4Q3TKT4 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.11■■■□□ 2.41
Smarca4Q3TKT4 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC30.11■■■□□ 2.41
Smarca4Q3TKT4 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
Smarca4Q3TKT4 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC30.11■■■□□ 2.41
Smarca4Q3TKT4 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC30.11■■■□□ 2.41
Smarca4Q3TKT4 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Smarca4Q3TKT4 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Smarca4Q3TKT4 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
Smarca4Q3TKT4 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
Smarca4Q3TKT4 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Smarca4Q3TKT4 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Smarca4Q3TKT4 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Smarca4Q3TKT4 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Smarca4Q3TKT4 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Smarca4Q3TKT4 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC30.1■■■□□ 2.41
Smarca4Q3TKT4 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC30.09■■■□□ 2.41
Smarca4Q3TKT4 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
Smarca4Q3TKT4 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
Smarca4Q3TKT4 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.09■■■□□ 2.41
Smarca4Q3TKT4 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
Smarca4Q3TKT4 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
Smarca4Q3TKT4 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC30.09■■■□□ 2.41
Smarca4Q3TKT4 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.09■■■□□ 2.41
Smarca4Q3TKT4 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
Smarca4Q3TKT4 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
Smarca4Q3TKT4 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC30.09■■■□□ 2.41
Smarca4Q3TKT4 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Smarca4Q3TKT4 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
Smarca4Q3TKT4 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Smarca4Q3TKT4 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
Smarca4Q3TKT4 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
Smarca4Q3TKT4 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
Smarca4Q3TKT4 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Smarca4Q3TKT4 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
Smarca4Q3TKT4 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.08■■■□□ 2.41
Smarca4Q3TKT4 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Smarca4Q3TKT4 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC30.07■■■□□ 2.4
Smarca4Q3TKT4 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.07■■■□□ 2.4
Smarca4Q3TKT4 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Smarca4Q3TKT4 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Smarca4Q3TKT4 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Smarca4Q3TKT4 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Smarca4Q3TKT4 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Smarca4Q3TKT4 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Smarca4Q3TKT4 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC30.07■■■□□ 2.4
Smarca4Q3TKT4 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC30.07■■■□□ 2.4
Smarca4Q3TKT4 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
Smarca4Q3TKT4 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Smarca4Q3TKT4 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Smarca4Q3TKT4 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Smarca4Q3TKT4 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC30.07■■■□□ 2.4
Smarca4Q3TKT4 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
Smarca4Q3TKT4 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
Smarca4Q3TKT4 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Smarca4Q3TKT4 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms