Protein–RNA interactions for Protein: Q3TIX6

Fubp3, Far upstream element (FUSE)-binding protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 575 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fubp3Q3TIX6 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Fubp3Q3TIX6 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Fubp3Q3TIX6 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Fubp3Q3TIX6 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Fubp3Q3TIX6 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Fubp3Q3TIX6 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Fubp3Q3TIX6 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Fubp3Q3TIX6 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Fubp3Q3TIX6 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Fubp3Q3TIX6 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Fubp3Q3TIX6 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Fubp3Q3TIX6 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Fubp3Q3TIX6 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Fubp3Q3TIX6 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Fubp3Q3TIX6 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Fubp3Q3TIX6 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Fubp3Q3TIX6 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Fubp3Q3TIX6 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Fubp3Q3TIX6 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Fubp3Q3TIX6 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Fubp3Q3TIX6 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Fubp3Q3TIX6 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Fubp3Q3TIX6 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Fubp3Q3TIX6 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Fubp3Q3TIX6 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Fubp3Q3TIX6 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Fubp3Q3TIX6 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Fubp3Q3TIX6 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Fubp3Q3TIX6 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Fubp3Q3TIX6 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Fubp3Q3TIX6 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Fubp3Q3TIX6 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Fubp3Q3TIX6 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Fubp3Q3TIX6 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Fubp3Q3TIX6 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Fubp3Q3TIX6 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Fubp3Q3TIX6 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Fubp3Q3TIX6 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Fubp3Q3TIX6 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Fubp3Q3TIX6 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Fubp3Q3TIX6 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Fubp3Q3TIX6 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Fubp3Q3TIX6 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Fubp3Q3TIX6 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Fubp3Q3TIX6 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Fubp3Q3TIX6 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Fubp3Q3TIX6 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Fubp3Q3TIX6 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Fubp3Q3TIX6 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Fubp3Q3TIX6 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Fubp3Q3TIX6 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Fubp3Q3TIX6 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Fubp3Q3TIX6 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Fubp3Q3TIX6 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Fubp3Q3TIX6 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Fubp3Q3TIX6 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Fubp3Q3TIX6 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Fubp3Q3TIX6 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Fubp3Q3TIX6 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Fubp3Q3TIX6 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Fubp3Q3TIX6 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Fubp3Q3TIX6 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Fubp3Q3TIX6 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Fubp3Q3TIX6 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Fubp3Q3TIX6 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Fubp3Q3TIX6 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Fubp3Q3TIX6 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Fubp3Q3TIX6 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Fubp3Q3TIX6 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Fubp3Q3TIX6 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Fubp3Q3TIX6 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Fubp3Q3TIX6 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Fubp3Q3TIX6 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Fubp3Q3TIX6 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Fubp3Q3TIX6 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Fubp3Q3TIX6 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Fubp3Q3TIX6 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Fubp3Q3TIX6 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Fubp3Q3TIX6 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Fubp3Q3TIX6 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Fubp3Q3TIX6 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Fubp3Q3TIX6 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Fubp3Q3TIX6 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Fubp3Q3TIX6 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Fubp3Q3TIX6 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Fubp3Q3TIX6 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Fubp3Q3TIX6 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Fubp3Q3TIX6 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Fubp3Q3TIX6 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Fubp3Q3TIX6 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Fubp3Q3TIX6 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Fubp3Q3TIX6 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Fubp3Q3TIX6 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Fubp3Q3TIX6 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Fubp3Q3TIX6 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Fubp3Q3TIX6 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Fubp3Q3TIX6 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Fubp3Q3TIX6 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Fubp3Q3TIX6 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Fubp3Q3TIX6 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.4 ms