Protein–RNA interactions for Protein: Q3TDV8

Zfp444, Zinc finger protein 444, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 331 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp444Q3TDV8 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Zfp444Q3TDV8 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Zfp444Q3TDV8 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Zfp444Q3TDV8 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Zfp444Q3TDV8 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Zfp444Q3TDV8 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Zfp444Q3TDV8 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Zfp444Q3TDV8 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Zfp444Q3TDV8 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Zfp444Q3TDV8 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Zfp444Q3TDV8 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Zfp444Q3TDV8 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Zfp444Q3TDV8 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Zfp444Q3TDV8 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Zfp444Q3TDV8 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Zfp444Q3TDV8 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Zfp444Q3TDV8 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Zfp444Q3TDV8 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Zfp444Q3TDV8 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Zfp444Q3TDV8 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Zfp444Q3TDV8 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Zfp444Q3TDV8 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Zfp444Q3TDV8 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Zfp444Q3TDV8 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Zfp444Q3TDV8 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Zfp444Q3TDV8 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Zfp444Q3TDV8 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Zfp444Q3TDV8 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Zfp444Q3TDV8 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Zfp444Q3TDV8 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Zfp444Q3TDV8 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Zfp444Q3TDV8 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Zfp444Q3TDV8 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Zfp444Q3TDV8 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Zfp444Q3TDV8 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Zfp444Q3TDV8 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Zfp444Q3TDV8 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Zfp444Q3TDV8 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Zfp444Q3TDV8 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Zfp444Q3TDV8 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Zfp444Q3TDV8 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Zfp444Q3TDV8 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Zfp444Q3TDV8 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Zfp444Q3TDV8 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Zfp444Q3TDV8 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Zfp444Q3TDV8 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Zfp444Q3TDV8 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Zfp444Q3TDV8 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Zfp444Q3TDV8 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Zfp444Q3TDV8 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Zfp444Q3TDV8 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Zfp444Q3TDV8 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Zfp444Q3TDV8 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Zfp444Q3TDV8 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Zfp444Q3TDV8 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Zfp444Q3TDV8 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Zfp444Q3TDV8 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Zfp444Q3TDV8 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Zfp444Q3TDV8 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Zfp444Q3TDV8 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Zfp444Q3TDV8 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Zfp444Q3TDV8 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Zfp444Q3TDV8 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Zfp444Q3TDV8 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Zfp444Q3TDV8 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Zfp444Q3TDV8 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Zfp444Q3TDV8 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Zfp444Q3TDV8 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Zfp444Q3TDV8 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Zfp444Q3TDV8 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Zfp444Q3TDV8 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Zfp444Q3TDV8 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Zfp444Q3TDV8 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Zfp444Q3TDV8 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Zfp444Q3TDV8 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Zfp444Q3TDV8 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Zfp444Q3TDV8 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Zfp444Q3TDV8 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Zfp444Q3TDV8 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Zfp444Q3TDV8 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Zfp444Q3TDV8 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Zfp444Q3TDV8 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Zfp444Q3TDV8 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Zfp444Q3TDV8 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Zfp444Q3TDV8 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Zfp444Q3TDV8 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Zfp444Q3TDV8 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Zfp444Q3TDV8 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Zfp444Q3TDV8 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Zfp444Q3TDV8 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Zfp444Q3TDV8 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Zfp444Q3TDV8 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Zfp444Q3TDV8 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Zfp444Q3TDV8 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Zfp444Q3TDV8 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Zfp444Q3TDV8 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Zfp444Q3TDV8 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Zfp444Q3TDV8 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Zfp444Q3TDV8 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Zfp444Q3TDV8 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.7 ms