Protein–RNA interactions for Protein: Q3TDQ1

Stt3b, Dolichyl-diphosphooligosaccharide--protein glycosyltransferase subunit STT3B, mousemouse

Predictions only

Length 823 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stt3bQ3TDQ1 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Stt3bQ3TDQ1 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Stt3bQ3TDQ1 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Stt3bQ3TDQ1 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Stt3bQ3TDQ1 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Stt3bQ3TDQ1 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Stt3bQ3TDQ1 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Stt3bQ3TDQ1 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Stt3bQ3TDQ1 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Stt3bQ3TDQ1 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Stt3bQ3TDQ1 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Stt3bQ3TDQ1 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Stt3bQ3TDQ1 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Stt3bQ3TDQ1 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Stt3bQ3TDQ1 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Stt3bQ3TDQ1 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Stt3bQ3TDQ1 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Stt3bQ3TDQ1 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Stt3bQ3TDQ1 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
Stt3bQ3TDQ1 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Stt3bQ3TDQ1 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Stt3bQ3TDQ1 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Stt3bQ3TDQ1 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Stt3bQ3TDQ1 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Stt3bQ3TDQ1 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Stt3bQ3TDQ1 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Stt3bQ3TDQ1 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Stt3bQ3TDQ1 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Stt3bQ3TDQ1 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Stt3bQ3TDQ1 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Stt3bQ3TDQ1 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Stt3bQ3TDQ1 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Stt3bQ3TDQ1 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Stt3bQ3TDQ1 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Stt3bQ3TDQ1 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Stt3bQ3TDQ1 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Stt3bQ3TDQ1 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Stt3bQ3TDQ1 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Stt3bQ3TDQ1 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Stt3bQ3TDQ1 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Stt3bQ3TDQ1 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Stt3bQ3TDQ1 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Stt3bQ3TDQ1 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Stt3bQ3TDQ1 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Stt3bQ3TDQ1 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Stt3bQ3TDQ1 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Stt3bQ3TDQ1 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Stt3bQ3TDQ1 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Stt3bQ3TDQ1 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Stt3bQ3TDQ1 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Stt3bQ3TDQ1 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Stt3bQ3TDQ1 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Stt3bQ3TDQ1 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Stt3bQ3TDQ1 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Stt3bQ3TDQ1 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Stt3bQ3TDQ1 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Stt3bQ3TDQ1 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Stt3bQ3TDQ1 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Stt3bQ3TDQ1 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Stt3bQ3TDQ1 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Stt3bQ3TDQ1 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Stt3bQ3TDQ1 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Stt3bQ3TDQ1 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Stt3bQ3TDQ1 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Stt3bQ3TDQ1 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Stt3bQ3TDQ1 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Stt3bQ3TDQ1 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Stt3bQ3TDQ1 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Stt3bQ3TDQ1 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Stt3bQ3TDQ1 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Stt3bQ3TDQ1 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Stt3bQ3TDQ1 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Stt3bQ3TDQ1 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Stt3bQ3TDQ1 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Stt3bQ3TDQ1 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Stt3bQ3TDQ1 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Stt3bQ3TDQ1 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Stt3bQ3TDQ1 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Stt3bQ3TDQ1 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Stt3bQ3TDQ1 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Stt3bQ3TDQ1 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Stt3bQ3TDQ1 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Stt3bQ3TDQ1 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Stt3bQ3TDQ1 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Stt3bQ3TDQ1 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Stt3bQ3TDQ1 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Stt3bQ3TDQ1 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Stt3bQ3TDQ1 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Stt3bQ3TDQ1 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Stt3bQ3TDQ1 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Stt3bQ3TDQ1 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Stt3bQ3TDQ1 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Stt3bQ3TDQ1 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Stt3bQ3TDQ1 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Stt3bQ3TDQ1 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Stt3bQ3TDQ1 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Stt3bQ3TDQ1 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Stt3bQ3TDQ1 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Stt3bQ3TDQ1 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Stt3bQ3TDQ1 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.9 ms