Protein–RNA interactions for Protein: Q3SYJ2

Prr27, 4930432K09Rik protein, mousemouse

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prr27Q3SYJ2 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Prr27Q3SYJ2 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Prr27Q3SYJ2 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Prr27Q3SYJ2 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Prr27Q3SYJ2 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Prr27Q3SYJ2 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Prr27Q3SYJ2 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Prr27Q3SYJ2 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Prr27Q3SYJ2 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Prr27Q3SYJ2 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Prr27Q3SYJ2 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Prr27Q3SYJ2 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Prr27Q3SYJ2 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Prr27Q3SYJ2 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Prr27Q3SYJ2 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Prr27Q3SYJ2 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Prr27Q3SYJ2 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Prr27Q3SYJ2 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Prr27Q3SYJ2 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Prr27Q3SYJ2 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Prr27Q3SYJ2 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Prr27Q3SYJ2 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Prr27Q3SYJ2 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Prr27Q3SYJ2 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Prr27Q3SYJ2 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Prr27Q3SYJ2 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Prr27Q3SYJ2 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Prr27Q3SYJ2 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Prr27Q3SYJ2 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Prr27Q3SYJ2 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Prr27Q3SYJ2 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Prr27Q3SYJ2 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Prr27Q3SYJ2 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Prr27Q3SYJ2 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Prr27Q3SYJ2 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Prr27Q3SYJ2 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Prr27Q3SYJ2 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Prr27Q3SYJ2 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Prr27Q3SYJ2 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Prr27Q3SYJ2 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Prr27Q3SYJ2 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Prr27Q3SYJ2 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Prr27Q3SYJ2 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Prr27Q3SYJ2 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Prr27Q3SYJ2 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Prr27Q3SYJ2 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Prr27Q3SYJ2 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Prr27Q3SYJ2 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Prr27Q3SYJ2 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Prr27Q3SYJ2 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Prr27Q3SYJ2 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Prr27Q3SYJ2 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Prr27Q3SYJ2 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Prr27Q3SYJ2 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Prr27Q3SYJ2 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Prr27Q3SYJ2 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Prr27Q3SYJ2 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Prr27Q3SYJ2 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Prr27Q3SYJ2 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Prr27Q3SYJ2 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Prr27Q3SYJ2 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Prr27Q3SYJ2 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Prr27Q3SYJ2 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Prr27Q3SYJ2 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Prr27Q3SYJ2 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Prr27Q3SYJ2 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Prr27Q3SYJ2 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Prr27Q3SYJ2 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Prr27Q3SYJ2 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Prr27Q3SYJ2 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Prr27Q3SYJ2 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Prr27Q3SYJ2 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Prr27Q3SYJ2 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Prr27Q3SYJ2 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Prr27Q3SYJ2 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Prr27Q3SYJ2 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Prr27Q3SYJ2 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Prr27Q3SYJ2 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Prr27Q3SYJ2 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Prr27Q3SYJ2 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Prr27Q3SYJ2 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Prr27Q3SYJ2 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Prr27Q3SYJ2 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Prr27Q3SYJ2 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Prr27Q3SYJ2 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Prr27Q3SYJ2 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Prr27Q3SYJ2 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Prr27Q3SYJ2 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Prr27Q3SYJ2 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Prr27Q3SYJ2 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Prr27Q3SYJ2 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Prr27Q3SYJ2 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Prr27Q3SYJ2 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Prr27Q3SYJ2 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Prr27Q3SYJ2 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Prr27Q3SYJ2 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Prr27Q3SYJ2 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Prr27Q3SYJ2 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Prr27Q3SYJ2 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Prr27Q3SYJ2 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms