Protein–RNA interactions for Protein: Q33DR3

Pdss2, Decaprenyl-diphosphate synthase subunit 2, mousemouse

Predictions only

Length 401 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdss2Q33DR3 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pdss2Q33DR3 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pdss2Q33DR3 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pdss2Q33DR3 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pdss2Q33DR3 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pdss2Q33DR3 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pdss2Q33DR3 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pdss2Q33DR3 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pdss2Q33DR3 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pdss2Q33DR3 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pdss2Q33DR3 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pdss2Q33DR3 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pdss2Q33DR3 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pdss2Q33DR3 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pdss2Q33DR3 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pdss2Q33DR3 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pdss2Q33DR3 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pdss2Q33DR3 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pdss2Q33DR3 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pdss2Q33DR3 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pdss2Q33DR3 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pdss2Q33DR3 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pdss2Q33DR3 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pdss2Q33DR3 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pdss2Q33DR3 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pdss2Q33DR3 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pdss2Q33DR3 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pdss2Q33DR3 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pdss2Q33DR3 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pdss2Q33DR3 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pdss2Q33DR3 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pdss2Q33DR3 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pdss2Q33DR3 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pdss2Q33DR3 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pdss2Q33DR3 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pdss2Q33DR3 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pdss2Q33DR3 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pdss2Q33DR3 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pdss2Q33DR3 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pdss2Q33DR3 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pdss2Q33DR3 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pdss2Q33DR3 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Pdss2Q33DR3 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pdss2Q33DR3 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Pdss2Q33DR3 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pdss2Q33DR3 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pdss2Q33DR3 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Pdss2Q33DR3 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pdss2Q33DR3 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pdss2Q33DR3 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pdss2Q33DR3 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pdss2Q33DR3 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pdss2Q33DR3 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pdss2Q33DR3 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pdss2Q33DR3 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pdss2Q33DR3 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Pdss2Q33DR3 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pdss2Q33DR3 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pdss2Q33DR3 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pdss2Q33DR3 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pdss2Q33DR3 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pdss2Q33DR3 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pdss2Q33DR3 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pdss2Q33DR3 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pdss2Q33DR3 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pdss2Q33DR3 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pdss2Q33DR3 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pdss2Q33DR3 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pdss2Q33DR3 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pdss2Q33DR3 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pdss2Q33DR3 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pdss2Q33DR3 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pdss2Q33DR3 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pdss2Q33DR3 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pdss2Q33DR3 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pdss2Q33DR3 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pdss2Q33DR3 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Pdss2Q33DR3 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pdss2Q33DR3 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pdss2Q33DR3 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pdss2Q33DR3 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pdss2Q33DR3 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pdss2Q33DR3 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pdss2Q33DR3 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pdss2Q33DR3 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pdss2Q33DR3 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pdss2Q33DR3 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pdss2Q33DR3 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pdss2Q33DR3 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pdss2Q33DR3 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pdss2Q33DR3 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pdss2Q33DR3 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pdss2Q33DR3 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pdss2Q33DR3 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pdss2Q33DR3 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pdss2Q33DR3 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pdss2Q33DR3 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pdss2Q33DR3 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pdss2Q33DR3 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pdss2Q33DR3 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.8 ms