Protein–RNA interactions for Protein: Q2QI47

Ush2A, Usherin, mousemouse

Predictions only

Length 5,193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ush2AQ2QI47 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Ush2AQ2QI47 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
Ush2AQ2QI47 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC9.36□□□□□ -0.91
Ush2AQ2QI47 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Ush2AQ2QI47 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.36□□□□□ -0.91
Ush2AQ2QI47 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
Ush2AQ2QI47 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Ush2AQ2QI47 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
Ush2AQ2QI47 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
Ush2AQ2QI47 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Ush2AQ2QI47 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Ush2AQ2QI47 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Ush2AQ2QI47 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC9.36□□□□□ -0.91
Ush2AQ2QI47 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
Ush2AQ2QI47 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC9.36□□□□□ -0.91
Ush2AQ2QI47 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Ush2AQ2QI47 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC9.36□□□□□ -0.91
Ush2AQ2QI47 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Ush2AQ2QI47 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Ush2AQ2QI47 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Ush2AQ2QI47 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Ush2AQ2QI47 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Ush2AQ2QI47 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.36□□□□□ -0.91
Ush2AQ2QI47 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC9.36□□□□□ -0.91
Ush2AQ2QI47 Gm37933-201ENSMUST00000193964 981 ntTSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Ush2AQ2QI47 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Ush2AQ2QI47 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Ush2AQ2QI47 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Ush2AQ2QI47 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Ush2AQ2QI47 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC9.36□□□□□ -0.91
Ush2AQ2QI47 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Ush2AQ2QI47 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Ush2AQ2QI47 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Ush2AQ2QI47 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Ush2AQ2QI47 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Ush2AQ2QI47 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Ush2AQ2QI47 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Ush2AQ2QI47 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Ush2AQ2QI47 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Ush2AQ2QI47 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Ush2AQ2QI47 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Ush2AQ2QI47 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Ush2AQ2QI47 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Ush2AQ2QI47 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Ush2AQ2QI47 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Ush2AQ2QI47 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Ush2AQ2QI47 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
Ush2AQ2QI47 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Ush2AQ2QI47 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Ush2AQ2QI47 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Ush2AQ2QI47 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Ush2AQ2QI47 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Ush2AQ2QI47 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Ush2AQ2QI47 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Ush2AQ2QI47 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Ush2AQ2QI47 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Ush2AQ2QI47 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Ush2AQ2QI47 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Ush2AQ2QI47 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Ush2AQ2QI47 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Ush2AQ2QI47 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Ush2AQ2QI47 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Ush2AQ2QI47 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Ush2AQ2QI47 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Ush2AQ2QI47 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Ush2AQ2QI47 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Ush2AQ2QI47 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Ush2AQ2QI47 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Ush2AQ2QI47 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Ush2AQ2QI47 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Ush2AQ2QI47 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Ush2AQ2QI47 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Ush2AQ2QI47 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Ush2AQ2QI47 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Ush2AQ2QI47 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC9.34□□□□□ -0.91
Ush2AQ2QI47 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Ush2AQ2QI47 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Ush2AQ2QI47 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Ush2AQ2QI47 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Ush2AQ2QI47 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Ush2AQ2QI47 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Ush2AQ2QI47 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Ush2AQ2QI47 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Ush2AQ2QI47 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Ush2AQ2QI47 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Ush2AQ2QI47 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Ush2AQ2QI47 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Ush2AQ2QI47 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Ush2AQ2QI47 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC9.34□□□□□ -0.92
Ush2AQ2QI47 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.92
Ush2AQ2QI47 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC9.34□□□□□ -0.92
Ush2AQ2QI47 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.92
Ush2AQ2QI47 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.92
Ush2AQ2QI47 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Ush2AQ2QI47 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Ush2AQ2QI47 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Ush2AQ2QI47 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC9.33□□□□□ -0.92
Ush2AQ2QI47 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC9.33□□□□□ -0.92
Ush2AQ2QI47 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Ush2AQ2QI47 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms