Protein–RNA interactions for Protein: Q1RNF8

Samd11, Sterile alpha motif domain-containing protein 11, mousemouse

Predictions only

Length 542 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd11Q1RNF8 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Samd11Q1RNF8 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Samd11Q1RNF8 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Samd11Q1RNF8 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Samd11Q1RNF8 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Samd11Q1RNF8 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Samd11Q1RNF8 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Samd11Q1RNF8 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Samd11Q1RNF8 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Samd11Q1RNF8 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Samd11Q1RNF8 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Samd11Q1RNF8 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Samd11Q1RNF8 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Samd11Q1RNF8 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Samd11Q1RNF8 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Samd11Q1RNF8 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Samd11Q1RNF8 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Samd11Q1RNF8 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Samd11Q1RNF8 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Samd11Q1RNF8 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Samd11Q1RNF8 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Samd11Q1RNF8 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Samd11Q1RNF8 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Samd11Q1RNF8 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Samd11Q1RNF8 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Samd11Q1RNF8 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Samd11Q1RNF8 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Samd11Q1RNF8 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Samd11Q1RNF8 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Samd11Q1RNF8 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Samd11Q1RNF8 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Samd11Q1RNF8 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Samd11Q1RNF8 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Samd11Q1RNF8 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Samd11Q1RNF8 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Samd11Q1RNF8 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Samd11Q1RNF8 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Samd11Q1RNF8 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Samd11Q1RNF8 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Samd11Q1RNF8 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Samd11Q1RNF8 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Samd11Q1RNF8 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Samd11Q1RNF8 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Samd11Q1RNF8 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Samd11Q1RNF8 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Samd11Q1RNF8 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Samd11Q1RNF8 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Samd11Q1RNF8 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Samd11Q1RNF8 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Samd11Q1RNF8 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Samd11Q1RNF8 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Samd11Q1RNF8 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Samd11Q1RNF8 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Samd11Q1RNF8 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Samd11Q1RNF8 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Samd11Q1RNF8 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Samd11Q1RNF8 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Samd11Q1RNF8 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Samd11Q1RNF8 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Samd11Q1RNF8 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Samd11Q1RNF8 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Samd11Q1RNF8 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Samd11Q1RNF8 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Samd11Q1RNF8 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Samd11Q1RNF8 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Samd11Q1RNF8 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Samd11Q1RNF8 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Samd11Q1RNF8 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Samd11Q1RNF8 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Samd11Q1RNF8 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Samd11Q1RNF8 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Samd11Q1RNF8 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Samd11Q1RNF8 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Samd11Q1RNF8 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Samd11Q1RNF8 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Samd11Q1RNF8 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Samd11Q1RNF8 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Samd11Q1RNF8 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Samd11Q1RNF8 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Samd11Q1RNF8 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Samd11Q1RNF8 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Samd11Q1RNF8 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Samd11Q1RNF8 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Samd11Q1RNF8 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Samd11Q1RNF8 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Samd11Q1RNF8 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Samd11Q1RNF8 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Samd11Q1RNF8 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Samd11Q1RNF8 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Samd11Q1RNF8 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Samd11Q1RNF8 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Samd11Q1RNF8 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Samd11Q1RNF8 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Samd11Q1RNF8 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Samd11Q1RNF8 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Samd11Q1RNF8 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Samd11Q1RNF8 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Samd11Q1RNF8 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Samd11Q1RNF8 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Samd11Q1RNF8 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms