Protein–RNA interactions for Protein: Q1RLL3

Cpne9, Copine-9, mousemouse

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Length 553 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpne9Q1RLL3 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cpne9Q1RLL3 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cpne9Q1RLL3 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cpne9Q1RLL3 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cpne9Q1RLL3 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cpne9Q1RLL3 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cpne9Q1RLL3 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cpne9Q1RLL3 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cpne9Q1RLL3 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cpne9Q1RLL3 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cpne9Q1RLL3 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cpne9Q1RLL3 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cpne9Q1RLL3 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cpne9Q1RLL3 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cpne9Q1RLL3 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cpne9Q1RLL3 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cpne9Q1RLL3 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cpne9Q1RLL3 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cpne9Q1RLL3 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cpne9Q1RLL3 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Cpne9Q1RLL3 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cpne9Q1RLL3 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cpne9Q1RLL3 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cpne9Q1RLL3 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cpne9Q1RLL3 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cpne9Q1RLL3 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cpne9Q1RLL3 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cpne9Q1RLL3 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cpne9Q1RLL3 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cpne9Q1RLL3 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Cpne9Q1RLL3 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cpne9Q1RLL3 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cpne9Q1RLL3 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cpne9Q1RLL3 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cpne9Q1RLL3 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cpne9Q1RLL3 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Cpne9Q1RLL3 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Cpne9Q1RLL3 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cpne9Q1RLL3 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cpne9Q1RLL3 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cpne9Q1RLL3 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cpne9Q1RLL3 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cpne9Q1RLL3 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cpne9Q1RLL3 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cpne9Q1RLL3 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cpne9Q1RLL3 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cpne9Q1RLL3 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cpne9Q1RLL3 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cpne9Q1RLL3 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cpne9Q1RLL3 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cpne9Q1RLL3 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cpne9Q1RLL3 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cpne9Q1RLL3 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cpne9Q1RLL3 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cpne9Q1RLL3 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cpne9Q1RLL3 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cpne9Q1RLL3 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cpne9Q1RLL3 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cpne9Q1RLL3 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Cpne9Q1RLL3 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cpne9Q1RLL3 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Cpne9Q1RLL3 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Cpne9Q1RLL3 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Cpne9Q1RLL3 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cpne9Q1RLL3 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cpne9Q1RLL3 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cpne9Q1RLL3 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cpne9Q1RLL3 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cpne9Q1RLL3 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cpne9Q1RLL3 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cpne9Q1RLL3 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cpne9Q1RLL3 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cpne9Q1RLL3 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cpne9Q1RLL3 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cpne9Q1RLL3 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cpne9Q1RLL3 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cpne9Q1RLL3 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cpne9Q1RLL3 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cpne9Q1RLL3 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cpne9Q1RLL3 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cpne9Q1RLL3 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cpne9Q1RLL3 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cpne9Q1RLL3 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cpne9Q1RLL3 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cpne9Q1RLL3 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cpne9Q1RLL3 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cpne9Q1RLL3 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cpne9Q1RLL3 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Cpne9Q1RLL3 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cpne9Q1RLL3 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cpne9Q1RLL3 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cpne9Q1RLL3 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cpne9Q1RLL3 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cpne9Q1RLL3 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cpne9Q1RLL3 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cpne9Q1RLL3 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cpne9Q1RLL3 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cpne9Q1RLL3 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Cpne9Q1RLL3 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cpne9Q1RLL3 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
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