Protein–RNA interactions for Protein: Q1A3B0

Cers3, Ceramide synthase 3, mousemouse

Predictions only

Length 383 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cers3Q1A3B0 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cers3Q1A3B0 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cers3Q1A3B0 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cers3Q1A3B0 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Cers3Q1A3B0 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cers3Q1A3B0 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cers3Q1A3B0 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cers3Q1A3B0 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cers3Q1A3B0 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cers3Q1A3B0 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cers3Q1A3B0 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cers3Q1A3B0 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cers3Q1A3B0 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cers3Q1A3B0 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cers3Q1A3B0 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cers3Q1A3B0 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cers3Q1A3B0 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cers3Q1A3B0 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cers3Q1A3B0 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Cers3Q1A3B0 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cers3Q1A3B0 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cers3Q1A3B0 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cers3Q1A3B0 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cers3Q1A3B0 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cers3Q1A3B0 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cers3Q1A3B0 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cers3Q1A3B0 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cers3Q1A3B0 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cers3Q1A3B0 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cers3Q1A3B0 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cers3Q1A3B0 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cers3Q1A3B0 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cers3Q1A3B0 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cers3Q1A3B0 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cers3Q1A3B0 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cers3Q1A3B0 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cers3Q1A3B0 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cers3Q1A3B0 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cers3Q1A3B0 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cers3Q1A3B0 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cers3Q1A3B0 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cers3Q1A3B0 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cers3Q1A3B0 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cers3Q1A3B0 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cers3Q1A3B0 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cers3Q1A3B0 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cers3Q1A3B0 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cers3Q1A3B0 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cers3Q1A3B0 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Cers3Q1A3B0 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Cers3Q1A3B0 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Cers3Q1A3B0 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cers3Q1A3B0 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cers3Q1A3B0 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cers3Q1A3B0 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cers3Q1A3B0 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cers3Q1A3B0 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cers3Q1A3B0 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cers3Q1A3B0 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cers3Q1A3B0 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cers3Q1A3B0 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cers3Q1A3B0 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cers3Q1A3B0 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cers3Q1A3B0 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cers3Q1A3B0 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Cers3Q1A3B0 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cers3Q1A3B0 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cers3Q1A3B0 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cers3Q1A3B0 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cers3Q1A3B0 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cers3Q1A3B0 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cers3Q1A3B0 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cers3Q1A3B0 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cers3Q1A3B0 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cers3Q1A3B0 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cers3Q1A3B0 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cers3Q1A3B0 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Cers3Q1A3B0 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cers3Q1A3B0 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cers3Q1A3B0 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cers3Q1A3B0 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cers3Q1A3B0 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cers3Q1A3B0 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cers3Q1A3B0 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cers3Q1A3B0 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC21.77■■□□□ 1.07
Cers3Q1A3B0 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Cers3Q1A3B0 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Cers3Q1A3B0 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cers3Q1A3B0 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cers3Q1A3B0 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cers3Q1A3B0 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cers3Q1A3B0 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cers3Q1A3B0 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cers3Q1A3B0 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cers3Q1A3B0 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cers3Q1A3B0 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cers3Q1A3B0 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cers3Q1A3B0 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cers3Q1A3B0 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cers3Q1A3B0 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
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