Protein–RNA interactions for Protein: Q14BE7

Fam47c, Family with sequence similarity 47, member A, mousemouse

Predictions only

Length 430 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam47cQ14BE7 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Fam47cQ14BE7 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Fam47cQ14BE7 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Fam47cQ14BE7 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Fam47cQ14BE7 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Fam47cQ14BE7 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Fam47cQ14BE7 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Fam47cQ14BE7 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Fam47cQ14BE7 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Fam47cQ14BE7 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Fam47cQ14BE7 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Fam47cQ14BE7 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Fam47cQ14BE7 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Fam47cQ14BE7 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Fam47cQ14BE7 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Fam47cQ14BE7 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Fam47cQ14BE7 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Fam47cQ14BE7 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Fam47cQ14BE7 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Fam47cQ14BE7 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Fam47cQ14BE7 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Fam47cQ14BE7 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Fam47cQ14BE7 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Fam47cQ14BE7 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Fam47cQ14BE7 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Fam47cQ14BE7 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Fam47cQ14BE7 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Fam47cQ14BE7 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Fam47cQ14BE7 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Fam47cQ14BE7 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Fam47cQ14BE7 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Fam47cQ14BE7 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Fam47cQ14BE7 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Fam47cQ14BE7 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Fam47cQ14BE7 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Fam47cQ14BE7 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Fam47cQ14BE7 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Fam47cQ14BE7 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Fam47cQ14BE7 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Fam47cQ14BE7 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Fam47cQ14BE7 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Fam47cQ14BE7 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Fam47cQ14BE7 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Fam47cQ14BE7 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Fam47cQ14BE7 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Fam47cQ14BE7 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Fam47cQ14BE7 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Fam47cQ14BE7 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Fam47cQ14BE7 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Fam47cQ14BE7 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Fam47cQ14BE7 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Fam47cQ14BE7 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Fam47cQ14BE7 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Fam47cQ14BE7 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Fam47cQ14BE7 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Fam47cQ14BE7 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Fam47cQ14BE7 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Fam47cQ14BE7 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Fam47cQ14BE7 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Fam47cQ14BE7 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Fam47cQ14BE7 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Fam47cQ14BE7 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Fam47cQ14BE7 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Fam47cQ14BE7 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Fam47cQ14BE7 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Fam47cQ14BE7 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Fam47cQ14BE7 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Fam47cQ14BE7 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Fam47cQ14BE7 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Fam47cQ14BE7 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Fam47cQ14BE7 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Fam47cQ14BE7 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Fam47cQ14BE7 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Fam47cQ14BE7 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Fam47cQ14BE7 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Fam47cQ14BE7 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Fam47cQ14BE7 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Fam47cQ14BE7 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Fam47cQ14BE7 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Fam47cQ14BE7 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Fam47cQ14BE7 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Fam47cQ14BE7 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Fam47cQ14BE7 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Fam47cQ14BE7 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Fam47cQ14BE7 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Fam47cQ14BE7 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Fam47cQ14BE7 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Fam47cQ14BE7 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Fam47cQ14BE7 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Fam47cQ14BE7 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Fam47cQ14BE7 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Fam47cQ14BE7 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Fam47cQ14BE7 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Fam47cQ14BE7 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Fam47cQ14BE7 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Fam47cQ14BE7 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Fam47cQ14BE7 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Fam47cQ14BE7 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Fam47cQ14BE7 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Fam47cQ14BE7 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms