Protein–RNA interactions for Protein: Q149B8

Perm1, PGC-1 and ERR-induced regulator in muscle protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 807 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Perm1Q149B8 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
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Perm1Q149B8 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
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Perm1Q149B8 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Perm1Q149B8 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Perm1Q149B8 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
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Perm1Q149B8 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Perm1Q149B8 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Perm1Q149B8 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Perm1Q149B8 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Perm1Q149B8 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Perm1Q149B8 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Perm1Q149B8 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Perm1Q149B8 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Perm1Q149B8 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Perm1Q149B8 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Perm1Q149B8 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Perm1Q149B8 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Perm1Q149B8 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms