Protein–RNA interactions for Protein: Q0VG85

Ccdc162p, Coiled-coil domain-containing protein 162, mousemouse

Predictions only

Length 912 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc162pQ0VG85 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccdc162pQ0VG85 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccdc162pQ0VG85 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccdc162pQ0VG85 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccdc162pQ0VG85 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccdc162pQ0VG85 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccdc162pQ0VG85 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccdc162pQ0VG85 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ccdc162pQ0VG85 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ccdc162pQ0VG85 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ccdc162pQ0VG85 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ccdc162pQ0VG85 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ccdc162pQ0VG85 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Ccdc162pQ0VG85 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Ccdc162pQ0VG85 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc162pQ0VG85 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc162pQ0VG85 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc162pQ0VG85 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc162pQ0VG85 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc162pQ0VG85 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc162pQ0VG85 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc162pQ0VG85 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc162pQ0VG85 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc162pQ0VG85 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc162pQ0VG85 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccdc162pQ0VG85 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccdc162pQ0VG85 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccdc162pQ0VG85 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccdc162pQ0VG85 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccdc162pQ0VG85 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccdc162pQ0VG85 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccdc162pQ0VG85 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccdc162pQ0VG85 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccdc162pQ0VG85 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccdc162pQ0VG85 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccdc162pQ0VG85 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccdc162pQ0VG85 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccdc162pQ0VG85 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccdc162pQ0VG85 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccdc162pQ0VG85 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccdc162pQ0VG85 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccdc162pQ0VG85 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccdc162pQ0VG85 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ccdc162pQ0VG85 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ccdc162pQ0VG85 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ccdc162pQ0VG85 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ccdc162pQ0VG85 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ccdc162pQ0VG85 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ccdc162pQ0VG85 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ccdc162pQ0VG85 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ccdc162pQ0VG85 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ccdc162pQ0VG85 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ccdc162pQ0VG85 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ccdc162pQ0VG85 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ccdc162pQ0VG85 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ccdc162pQ0VG85 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ccdc162pQ0VG85 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ccdc162pQ0VG85 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccdc162pQ0VG85 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccdc162pQ0VG85 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccdc162pQ0VG85 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccdc162pQ0VG85 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccdc162pQ0VG85 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccdc162pQ0VG85 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccdc162pQ0VG85 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccdc162pQ0VG85 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccdc162pQ0VG85 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccdc162pQ0VG85 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccdc162pQ0VG85 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccdc162pQ0VG85 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccdc162pQ0VG85 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccdc162pQ0VG85 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccdc162pQ0VG85 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccdc162pQ0VG85 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccdc162pQ0VG85 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccdc162pQ0VG85 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccdc162pQ0VG85 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ccdc162pQ0VG85 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ccdc162pQ0VG85 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ccdc162pQ0VG85 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ccdc162pQ0VG85 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Ccdc162pQ0VG85 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ccdc162pQ0VG85 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ccdc162pQ0VG85 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ccdc162pQ0VG85 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ccdc162pQ0VG85 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ccdc162pQ0VG85 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ccdc162pQ0VG85 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ccdc162pQ0VG85 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ccdc162pQ0VG85 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ccdc162pQ0VG85 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ccdc162pQ0VG85 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ccdc162pQ0VG85 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ccdc162pQ0VG85 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ccdc162pQ0VG85 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ccdc162pQ0VG85 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ccdc162pQ0VG85 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ccdc162pQ0VG85 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ccdc162pQ0VG85 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ccdc162pQ0VG85 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms