Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF94

Nkpd1, NTPase KAP family P-loop domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 599 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkpd1Q0VF94 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nkpd1Q0VF94 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nkpd1Q0VF94 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nkpd1Q0VF94 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nkpd1Q0VF94 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nkpd1Q0VF94 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nkpd1Q0VF94 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nkpd1Q0VF94 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nkpd1Q0VF94 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nkpd1Q0VF94 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nkpd1Q0VF94 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nkpd1Q0VF94 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nkpd1Q0VF94 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nkpd1Q0VF94 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nkpd1Q0VF94 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nkpd1Q0VF94 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nkpd1Q0VF94 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nkpd1Q0VF94 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nkpd1Q0VF94 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nkpd1Q0VF94 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nkpd1Q0VF94 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nkpd1Q0VF94 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nkpd1Q0VF94 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nkpd1Q0VF94 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nkpd1Q0VF94 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nkpd1Q0VF94 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nkpd1Q0VF94 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nkpd1Q0VF94 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nkpd1Q0VF94 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nkpd1Q0VF94 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nkpd1Q0VF94 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nkpd1Q0VF94 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nkpd1Q0VF94 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nkpd1Q0VF94 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nkpd1Q0VF94 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nkpd1Q0VF94 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nkpd1Q0VF94 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nkpd1Q0VF94 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nkpd1Q0VF94 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nkpd1Q0VF94 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Nkpd1Q0VF94 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nkpd1Q0VF94 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nkpd1Q0VF94 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Nkpd1Q0VF94 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nkpd1Q0VF94 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Nkpd1Q0VF94 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Nkpd1Q0VF94 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Nkpd1Q0VF94 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Nkpd1Q0VF94 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Nkpd1Q0VF94 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Nkpd1Q0VF94 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Nkpd1Q0VF94 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nkpd1Q0VF94 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nkpd1Q0VF94 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nkpd1Q0VF94 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nkpd1Q0VF94 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nkpd1Q0VF94 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nkpd1Q0VF94 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nkpd1Q0VF94 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nkpd1Q0VF94 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nkpd1Q0VF94 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nkpd1Q0VF94 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nkpd1Q0VF94 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nkpd1Q0VF94 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nkpd1Q0VF94 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nkpd1Q0VF94 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nkpd1Q0VF94 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nkpd1Q0VF94 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Nkpd1Q0VF94 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nkpd1Q0VF94 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nkpd1Q0VF94 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nkpd1Q0VF94 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nkpd1Q0VF94 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nkpd1Q0VF94 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nkpd1Q0VF94 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nkpd1Q0VF94 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nkpd1Q0VF94 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nkpd1Q0VF94 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nkpd1Q0VF94 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nkpd1Q0VF94 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nkpd1Q0VF94 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nkpd1Q0VF94 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nkpd1Q0VF94 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nkpd1Q0VF94 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nkpd1Q0VF94 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nkpd1Q0VF94 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nkpd1Q0VF94 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nkpd1Q0VF94 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nkpd1Q0VF94 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nkpd1Q0VF94 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nkpd1Q0VF94 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nkpd1Q0VF94 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nkpd1Q0VF94 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nkpd1Q0VF94 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nkpd1Q0VF94 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nkpd1Q0VF94 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nkpd1Q0VF94 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nkpd1Q0VF94 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nkpd1Q0VF94 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nkpd1Q0VF94 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms