Protein–RNA interactions for Protein: Q0VET5

Lmntd2, Lamin tail domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 664 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmntd2Q0VET5 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Lmntd2Q0VET5 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Lmntd2Q0VET5 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Lmntd2Q0VET5 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Lmntd2Q0VET5 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Lmntd2Q0VET5 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Lmntd2Q0VET5 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Lmntd2Q0VET5 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Lmntd2Q0VET5 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Lmntd2Q0VET5 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Lmntd2Q0VET5 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Lmntd2Q0VET5 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Lmntd2Q0VET5 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Lmntd2Q0VET5 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Lmntd2Q0VET5 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Lmntd2Q0VET5 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Lmntd2Q0VET5 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Lmntd2Q0VET5 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Lmntd2Q0VET5 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Lmntd2Q0VET5 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Lmntd2Q0VET5 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Lmntd2Q0VET5 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Lmntd2Q0VET5 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Lmntd2Q0VET5 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Lmntd2Q0VET5 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Lmntd2Q0VET5 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Lmntd2Q0VET5 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Lmntd2Q0VET5 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Lmntd2Q0VET5 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Lmntd2Q0VET5 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Lmntd2Q0VET5 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Lmntd2Q0VET5 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Lmntd2Q0VET5 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Lmntd2Q0VET5 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Lmntd2Q0VET5 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Lmntd2Q0VET5 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Lmntd2Q0VET5 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Lmntd2Q0VET5 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Lmntd2Q0VET5 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Lmntd2Q0VET5 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Lmntd2Q0VET5 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Lmntd2Q0VET5 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Lmntd2Q0VET5 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Lmntd2Q0VET5 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Lmntd2Q0VET5 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Lmntd2Q0VET5 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Lmntd2Q0VET5 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Lmntd2Q0VET5 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Lmntd2Q0VET5 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Lmntd2Q0VET5 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Lmntd2Q0VET5 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Lmntd2Q0VET5 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Lmntd2Q0VET5 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Lmntd2Q0VET5 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Lmntd2Q0VET5 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Lmntd2Q0VET5 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Lmntd2Q0VET5 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Lmntd2Q0VET5 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Lmntd2Q0VET5 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Lmntd2Q0VET5 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Lmntd2Q0VET5 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Lmntd2Q0VET5 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Lmntd2Q0VET5 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Lmntd2Q0VET5 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Lmntd2Q0VET5 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Lmntd2Q0VET5 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Lmntd2Q0VET5 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Lmntd2Q0VET5 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Lmntd2Q0VET5 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Lmntd2Q0VET5 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Lmntd2Q0VET5 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Lmntd2Q0VET5 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Lmntd2Q0VET5 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Lmntd2Q0VET5 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Lmntd2Q0VET5 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Lmntd2Q0VET5 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Lmntd2Q0VET5 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Lmntd2Q0VET5 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Lmntd2Q0VET5 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Lmntd2Q0VET5 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Lmntd2Q0VET5 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Lmntd2Q0VET5 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Lmntd2Q0VET5 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Lmntd2Q0VET5 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Lmntd2Q0VET5 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Lmntd2Q0VET5 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Lmntd2Q0VET5 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Lmntd2Q0VET5 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Lmntd2Q0VET5 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Lmntd2Q0VET5 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Lmntd2Q0VET5 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Lmntd2Q0VET5 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Lmntd2Q0VET5 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Lmntd2Q0VET5 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Lmntd2Q0VET5 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
Lmntd2Q0VET5 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Lmntd2Q0VET5 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Lmntd2Q0VET5 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Lmntd2Q0VET5 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Lmntd2Q0VET5 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms