Protein–RNA interactions for Protein: Q0VE82

Cpne7, Copine-7, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpne7Q0VE82 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cpne7Q0VE82 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cpne7Q0VE82 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cpne7Q0VE82 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cpne7Q0VE82 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cpne7Q0VE82 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cpne7Q0VE82 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cpne7Q0VE82 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cpne7Q0VE82 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cpne7Q0VE82 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cpne7Q0VE82 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cpne7Q0VE82 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cpne7Q0VE82 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cpne7Q0VE82 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cpne7Q0VE82 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cpne7Q0VE82 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cpne7Q0VE82 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cpne7Q0VE82 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cpne7Q0VE82 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cpne7Q0VE82 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cpne7Q0VE82 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cpne7Q0VE82 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cpne7Q0VE82 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cpne7Q0VE82 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cpne7Q0VE82 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cpne7Q0VE82 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cpne7Q0VE82 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cpne7Q0VE82 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cpne7Q0VE82 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cpne7Q0VE82 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cpne7Q0VE82 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cpne7Q0VE82 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cpne7Q0VE82 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Cpne7Q0VE82 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cpne7Q0VE82 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cpne7Q0VE82 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cpne7Q0VE82 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cpne7Q0VE82 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cpne7Q0VE82 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cpne7Q0VE82 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cpne7Q0VE82 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cpne7Q0VE82 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cpne7Q0VE82 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cpne7Q0VE82 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cpne7Q0VE82 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cpne7Q0VE82 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cpne7Q0VE82 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cpne7Q0VE82 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cpne7Q0VE82 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cpne7Q0VE82 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cpne7Q0VE82 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Cpne7Q0VE82 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Cpne7Q0VE82 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cpne7Q0VE82 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cpne7Q0VE82 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cpne7Q0VE82 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cpne7Q0VE82 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cpne7Q0VE82 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cpne7Q0VE82 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cpne7Q0VE82 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cpne7Q0VE82 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cpne7Q0VE82 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cpne7Q0VE82 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cpne7Q0VE82 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cpne7Q0VE82 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cpne7Q0VE82 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cpne7Q0VE82 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cpne7Q0VE82 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cpne7Q0VE82 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cpne7Q0VE82 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Cpne7Q0VE82 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cpne7Q0VE82 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cpne7Q0VE82 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cpne7Q0VE82 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cpne7Q0VE82 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cpne7Q0VE82 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cpne7Q0VE82 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cpne7Q0VE82 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cpne7Q0VE82 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cpne7Q0VE82 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cpne7Q0VE82 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cpne7Q0VE82 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cpne7Q0VE82 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cpne7Q0VE82 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cpne7Q0VE82 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cpne7Q0VE82 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cpne7Q0VE82 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cpne7Q0VE82 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cpne7Q0VE82 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Cpne7Q0VE82 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cpne7Q0VE82 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cpne7Q0VE82 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cpne7Q0VE82 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cpne7Q0VE82 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Cpne7Q0VE82 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cpne7Q0VE82 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cpne7Q0VE82 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cpne7Q0VE82 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cpne7Q0VE82 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Cpne7Q0VE82 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.2 ms