Protein–RNA interactions for Protein: Q0P5W1

Vps8, Vacuolar protein sorting-associated protein 8 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps8Q0P5W1 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Vps8Q0P5W1 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Vps8Q0P5W1 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Vps8Q0P5W1 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Vps8Q0P5W1 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
Vps8Q0P5W1 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Vps8Q0P5W1 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Vps8Q0P5W1 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Vps8Q0P5W1 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Vps8Q0P5W1 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Vps8Q0P5W1 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Vps8Q0P5W1 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Vps8Q0P5W1 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Vps8Q0P5W1 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Vps8Q0P5W1 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Vps8Q0P5W1 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Vps8Q0P5W1 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Vps8Q0P5W1 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Vps8Q0P5W1 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Vps8Q0P5W1 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Vps8Q0P5W1 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Vps8Q0P5W1 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Vps8Q0P5W1 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Vps8Q0P5W1 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Vps8Q0P5W1 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Vps8Q0P5W1 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Vps8Q0P5W1 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Vps8Q0P5W1 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Vps8Q0P5W1 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Vps8Q0P5W1 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Vps8Q0P5W1 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Vps8Q0P5W1 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Vps8Q0P5W1 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Vps8Q0P5W1 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Vps8Q0P5W1 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Vps8Q0P5W1 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
Vps8Q0P5W1 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Vps8Q0P5W1 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Vps8Q0P5W1 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Vps8Q0P5W1 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Vps8Q0P5W1 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Vps8Q0P5W1 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Vps8Q0P5W1 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Vps8Q0P5W1 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Vps8Q0P5W1 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Vps8Q0P5W1 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Vps8Q0P5W1 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Vps8Q0P5W1 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Vps8Q0P5W1 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Vps8Q0P5W1 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Vps8Q0P5W1 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Vps8Q0P5W1 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
Vps8Q0P5W1 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
Vps8Q0P5W1 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
Vps8Q0P5W1 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Vps8Q0P5W1 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Vps8Q0P5W1 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Vps8Q0P5W1 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Vps8Q0P5W1 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Vps8Q0P5W1 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Vps8Q0P5W1 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Vps8Q0P5W1 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Vps8Q0P5W1 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Vps8Q0P5W1 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Vps8Q0P5W1 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Vps8Q0P5W1 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Vps8Q0P5W1 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Vps8Q0P5W1 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Vps8Q0P5W1 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Vps8Q0P5W1 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Vps8Q0P5W1 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Vps8Q0P5W1 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Vps8Q0P5W1 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Vps8Q0P5W1 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Vps8Q0P5W1 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
Vps8Q0P5W1 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Vps8Q0P5W1 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Vps8Q0P5W1 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Vps8Q0P5W1 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Vps8Q0P5W1 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Vps8Q0P5W1 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Vps8Q0P5W1 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Vps8Q0P5W1 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Vps8Q0P5W1 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Vps8Q0P5W1 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Vps8Q0P5W1 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Vps8Q0P5W1 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Vps8Q0P5W1 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Vps8Q0P5W1 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Vps8Q0P5W1 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Vps8Q0P5W1 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Vps8Q0P5W1 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Vps8Q0P5W1 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Vps8Q0P5W1 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Vps8Q0P5W1 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Vps8Q0P5W1 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Vps8Q0P5W1 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Vps8Q0P5W1 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Vps8Q0P5W1 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Vps8Q0P5W1 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 712.3 ms