Protein–RNA interactions for Protein: Q0KL02

Trio, Triple functional domain protein, mousemouse

Predictions only

Length 3,102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrioQ0KL02 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TrioQ0KL02 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TrioQ0KL02 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TrioQ0KL02 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TrioQ0KL02 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TrioQ0KL02 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TrioQ0KL02 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TrioQ0KL02 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TrioQ0KL02 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TrioQ0KL02 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TrioQ0KL02 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TrioQ0KL02 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TrioQ0KL02 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TrioQ0KL02 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TrioQ0KL02 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TrioQ0KL02 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TrioQ0KL02 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TrioQ0KL02 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TrioQ0KL02 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
TrioQ0KL02 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TrioQ0KL02 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TrioQ0KL02 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TrioQ0KL02 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TrioQ0KL02 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TrioQ0KL02 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TrioQ0KL02 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TrioQ0KL02 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TrioQ0KL02 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TrioQ0KL02 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TrioQ0KL02 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TrioQ0KL02 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TrioQ0KL02 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TrioQ0KL02 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TrioQ0KL02 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TrioQ0KL02 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TrioQ0KL02 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TrioQ0KL02 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TrioQ0KL02 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TrioQ0KL02 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TrioQ0KL02 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TrioQ0KL02 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TrioQ0KL02 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TrioQ0KL02 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TrioQ0KL02 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
TrioQ0KL02 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TrioQ0KL02 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TrioQ0KL02 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TrioQ0KL02 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TrioQ0KL02 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TrioQ0KL02 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
TrioQ0KL02 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
TrioQ0KL02 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.43
TrioQ0KL02 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
TrioQ0KL02 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
TrioQ0KL02 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.43
TrioQ0KL02 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
TrioQ0KL02 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
TrioQ0KL02 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
TrioQ0KL02 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.43
TrioQ0KL02 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
TrioQ0KL02 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TrioQ0KL02 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TrioQ0KL02 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TrioQ0KL02 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
TrioQ0KL02 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TrioQ0KL02 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TrioQ0KL02 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TrioQ0KL02 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TrioQ0KL02 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
TrioQ0KL02 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TrioQ0KL02 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TrioQ0KL02 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TrioQ0KL02 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TrioQ0KL02 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
TrioQ0KL02 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TrioQ0KL02 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
TrioQ0KL02 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TrioQ0KL02 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TrioQ0KL02 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TrioQ0KL02 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TrioQ0KL02 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TrioQ0KL02 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TrioQ0KL02 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TrioQ0KL02 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TrioQ0KL02 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TrioQ0KL02 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TrioQ0KL02 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TrioQ0KL02 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TrioQ0KL02 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TrioQ0KL02 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TrioQ0KL02 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TrioQ0KL02 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TrioQ0KL02 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
TrioQ0KL02 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TrioQ0KL02 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TrioQ0KL02 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TrioQ0KL02 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TrioQ0KL02 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TrioQ0KL02 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TrioQ0KL02 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms