Protein–RNA interactions for Protein: Q0II04

Nebl, Nebulette, mousemouse

Predictions only

Length 452 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NeblQ0II04 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
NeblQ0II04 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
NeblQ0II04 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NeblQ0II04 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
NeblQ0II04 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NeblQ0II04 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
NeblQ0II04 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NeblQ0II04 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NeblQ0II04 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NeblQ0II04 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
NeblQ0II04 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NeblQ0II04 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
NeblQ0II04 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
NeblQ0II04 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NeblQ0II04 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NeblQ0II04 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NeblQ0II04 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NeblQ0II04 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NeblQ0II04 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
NeblQ0II04 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
NeblQ0II04 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
NeblQ0II04 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NeblQ0II04 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
NeblQ0II04 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
NeblQ0II04 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NeblQ0II04 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NeblQ0II04 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NeblQ0II04 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NeblQ0II04 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NeblQ0II04 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NeblQ0II04 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NeblQ0II04 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NeblQ0II04 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NeblQ0II04 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
NeblQ0II04 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NeblQ0II04 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NeblQ0II04 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NeblQ0II04 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NeblQ0II04 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NeblQ0II04 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
NeblQ0II04 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NeblQ0II04 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NeblQ0II04 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NeblQ0II04 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NeblQ0II04 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NeblQ0II04 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
NeblQ0II04 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
NeblQ0II04 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
NeblQ0II04 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
NeblQ0II04 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
NeblQ0II04 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
NeblQ0II04 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
NeblQ0II04 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
NeblQ0II04 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
NeblQ0II04 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
NeblQ0II04 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
NeblQ0II04 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NeblQ0II04 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NeblQ0II04 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NeblQ0II04 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NeblQ0II04 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NeblQ0II04 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
NeblQ0II04 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NeblQ0II04 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NeblQ0II04 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
NeblQ0II04 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
NeblQ0II04 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
NeblQ0II04 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NeblQ0II04 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NeblQ0II04 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NeblQ0II04 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NeblQ0II04 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NeblQ0II04 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NeblQ0II04 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NeblQ0II04 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NeblQ0II04 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NeblQ0II04 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NeblQ0II04 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NeblQ0II04 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NeblQ0II04 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NeblQ0II04 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
NeblQ0II04 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NeblQ0II04 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NeblQ0II04 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NeblQ0II04 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NeblQ0II04 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NeblQ0II04 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NeblQ0II04 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NeblQ0II04 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NeblQ0II04 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NeblQ0II04 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NeblQ0II04 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NeblQ0II04 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NeblQ0II04 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NeblQ0II04 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NeblQ0II04 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NeblQ0II04 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NeblQ0II04 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NeblQ0II04 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NeblQ0II04 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.7 ms