Protein–RNA interactions for Protein: Q08EE8

1700061G19Rik, RIKEN cDNA 1700061G19 gene, mousemouse

Predictions only

Length 705 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700061G19RikQ08EE8 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
1700061G19RikQ08EE8 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
1700061G19RikQ08EE8 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
1700061G19RikQ08EE8 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
1700061G19RikQ08EE8 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
1700061G19RikQ08EE8 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
1700061G19RikQ08EE8 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
1700061G19RikQ08EE8 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
1700061G19RikQ08EE8 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
1700061G19RikQ08EE8 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
1700061G19RikQ08EE8 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
1700061G19RikQ08EE8 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
1700061G19RikQ08EE8 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
1700061G19RikQ08EE8 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
1700061G19RikQ08EE8 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
1700061G19RikQ08EE8 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
1700061G19RikQ08EE8 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
1700061G19RikQ08EE8 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
1700061G19RikQ08EE8 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
1700061G19RikQ08EE8 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
1700061G19RikQ08EE8 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
1700061G19RikQ08EE8 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
1700061G19RikQ08EE8 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
1700061G19RikQ08EE8 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
1700061G19RikQ08EE8 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
1700061G19RikQ08EE8 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
1700061G19RikQ08EE8 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
1700061G19RikQ08EE8 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
1700061G19RikQ08EE8 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
1700061G19RikQ08EE8 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
1700061G19RikQ08EE8 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
1700061G19RikQ08EE8 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
1700061G19RikQ08EE8 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
1700061G19RikQ08EE8 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
1700061G19RikQ08EE8 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
1700061G19RikQ08EE8 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
1700061G19RikQ08EE8 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
1700061G19RikQ08EE8 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
1700061G19RikQ08EE8 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
1700061G19RikQ08EE8 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
1700061G19RikQ08EE8 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
1700061G19RikQ08EE8 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
1700061G19RikQ08EE8 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
1700061G19RikQ08EE8 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
1700061G19RikQ08EE8 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
1700061G19RikQ08EE8 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
1700061G19RikQ08EE8 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
1700061G19RikQ08EE8 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
1700061G19RikQ08EE8 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
1700061G19RikQ08EE8 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
1700061G19RikQ08EE8 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
1700061G19RikQ08EE8 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
1700061G19RikQ08EE8 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
1700061G19RikQ08EE8 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
1700061G19RikQ08EE8 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
1700061G19RikQ08EE8 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
1700061G19RikQ08EE8 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
1700061G19RikQ08EE8 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
1700061G19RikQ08EE8 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
1700061G19RikQ08EE8 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
1700061G19RikQ08EE8 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
1700061G19RikQ08EE8 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
1700061G19RikQ08EE8 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
1700061G19RikQ08EE8 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
1700061G19RikQ08EE8 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
1700061G19RikQ08EE8 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
1700061G19RikQ08EE8 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
1700061G19RikQ08EE8 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
1700061G19RikQ08EE8 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
1700061G19RikQ08EE8 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
1700061G19RikQ08EE8 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
1700061G19RikQ08EE8 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
1700061G19RikQ08EE8 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
1700061G19RikQ08EE8 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
1700061G19RikQ08EE8 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
1700061G19RikQ08EE8 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
1700061G19RikQ08EE8 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
1700061G19RikQ08EE8 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
1700061G19RikQ08EE8 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
1700061G19RikQ08EE8 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
1700061G19RikQ08EE8 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
1700061G19RikQ08EE8 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
1700061G19RikQ08EE8 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
1700061G19RikQ08EE8 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
1700061G19RikQ08EE8 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
1700061G19RikQ08EE8 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
1700061G19RikQ08EE8 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
1700061G19RikQ08EE8 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
1700061G19RikQ08EE8 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
1700061G19RikQ08EE8 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
1700061G19RikQ08EE8 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
1700061G19RikQ08EE8 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
1700061G19RikQ08EE8 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
1700061G19RikQ08EE8 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
1700061G19RikQ08EE8 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
1700061G19RikQ08EE8 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
1700061G19RikQ08EE8 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
1700061G19RikQ08EE8 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
1700061G19RikQ08EE8 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
1700061G19RikQ08EE8 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.5 ms