Protein–RNA interactions for Protein: Q08369

Gata4, Transcription factor GATA-4, mousemouse

Predictions only

Length 441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gata4Q08369 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Gata4Q08369 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Gata4Q08369 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Gata4Q08369 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Gata4Q08369 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Gata4Q08369 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Gata4Q08369 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Gata4Q08369 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
Gata4Q08369 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Gata4Q08369 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Gata4Q08369 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
Gata4Q08369 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Gata4Q08369 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC14.02□□□□□ -0.16
Gata4Q08369 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.16
Gata4Q08369 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Gata4Q08369 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
Gata4Q08369 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC14.02□□□□□ -0.16
Gata4Q08369 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Gata4Q08369 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Gata4Q08369 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.16
Gata4Q08369 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Gata4Q08369 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Gata4Q08369 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Gata4Q08369 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Gata4Q08369 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Gata4Q08369 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Gata4Q08369 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Gata4Q08369 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Gata4Q08369 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Gata4Q08369 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Gata4Q08369 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
Gata4Q08369 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Gata4Q08369 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Gata4Q08369 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Gata4Q08369 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Gata4Q08369 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
Gata4Q08369 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Gata4Q08369 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Gata4Q08369 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Gata4Q08369 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Gata4Q08369 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Gata4Q08369 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Gata4Q08369 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Gata4Q08369 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Gata4Q08369 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Gata4Q08369 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Gata4Q08369 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Gata4Q08369 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Gata4Q08369 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Gata4Q08369 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Gata4Q08369 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
Gata4Q08369 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Gata4Q08369 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Gata4Q08369 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Gata4Q08369 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Gata4Q08369 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
Gata4Q08369 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Gata4Q08369 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Gata4Q08369 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Gata4Q08369 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Gata4Q08369 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Gata4Q08369 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Gata4Q08369 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Gata4Q08369 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Gata4Q08369 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Gata4Q08369 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Gata4Q08369 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Gata4Q08369 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Gata4Q08369 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Gata4Q08369 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Gata4Q08369 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Gata4Q08369 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Gata4Q08369 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Gata4Q08369 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Gata4Q08369 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC14□□□□□ -0.17
Gata4Q08369 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Gata4Q08369 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Gata4Q08369 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Gata4Q08369 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Gata4Q08369 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Gata4Q08369 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Gata4Q08369 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Gata4Q08369 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Gata4Q08369 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Gata4Q08369 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Gata4Q08369 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Gata4Q08369 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Gata4Q08369 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Gata4Q08369 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Gata4Q08369 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Gata4Q08369 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Gata4Q08369 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Gata4Q08369 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Gata4Q08369 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gata4Q08369 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gata4Q08369 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gata4Q08369 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gata4Q08369 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gata4Q08369 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Gata4Q08369 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms