Protein–RNA interactions for Protein: Q08024

Cbfb, Core-binding factor subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 187 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CbfbQ08024 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CbfbQ08024 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CbfbQ08024 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CbfbQ08024 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CbfbQ08024 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CbfbQ08024 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CbfbQ08024 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CbfbQ08024 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CbfbQ08024 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CbfbQ08024 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CbfbQ08024 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CbfbQ08024 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CbfbQ08024 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CbfbQ08024 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CbfbQ08024 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CbfbQ08024 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CbfbQ08024 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CbfbQ08024 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CbfbQ08024 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CbfbQ08024 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CbfbQ08024 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CbfbQ08024 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CbfbQ08024 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CbfbQ08024 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CbfbQ08024 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CbfbQ08024 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CbfbQ08024 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CbfbQ08024 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CbfbQ08024 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CbfbQ08024 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CbfbQ08024 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CbfbQ08024 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CbfbQ08024 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CbfbQ08024 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CbfbQ08024 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CbfbQ08024 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CbfbQ08024 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CbfbQ08024 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CbfbQ08024 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CbfbQ08024 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CbfbQ08024 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CbfbQ08024 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CbfbQ08024 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CbfbQ08024 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CbfbQ08024 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CbfbQ08024 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CbfbQ08024 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CbfbQ08024 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CbfbQ08024 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CbfbQ08024 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CbfbQ08024 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CbfbQ08024 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CbfbQ08024 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CbfbQ08024 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CbfbQ08024 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CbfbQ08024 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CbfbQ08024 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CbfbQ08024 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CbfbQ08024 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CbfbQ08024 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CbfbQ08024 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CbfbQ08024 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CbfbQ08024 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CbfbQ08024 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CbfbQ08024 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CbfbQ08024 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CbfbQ08024 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CbfbQ08024 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CbfbQ08024 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CbfbQ08024 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CbfbQ08024 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CbfbQ08024 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CbfbQ08024 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CbfbQ08024 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CbfbQ08024 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CbfbQ08024 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CbfbQ08024 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CbfbQ08024 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CbfbQ08024 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CbfbQ08024 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CbfbQ08024 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CbfbQ08024 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CbfbQ08024 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CbfbQ08024 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CbfbQ08024 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CbfbQ08024 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CbfbQ08024 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CbfbQ08024 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CbfbQ08024 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CbfbQ08024 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CbfbQ08024 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CbfbQ08024 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CbfbQ08024 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CbfbQ08024 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CbfbQ08024 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CbfbQ08024 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CbfbQ08024 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CbfbQ08024 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CbfbQ08024 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CbfbQ08024 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms