Protein–RNA interactions for Protein: Q07968

F13b, Coagulation factor XIII B chain, mousemouse

Predictions only

Length 669 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
F13bQ07968 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
F13bQ07968 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
F13bQ07968 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
F13bQ07968 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
F13bQ07968 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
F13bQ07968 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
F13bQ07968 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
F13bQ07968 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
F13bQ07968 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
F13bQ07968 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
F13bQ07968 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC15.04■□□□□ -0
F13bQ07968 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
F13bQ07968 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
F13bQ07968 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
F13bQ07968 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
F13bQ07968 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
F13bQ07968 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
F13bQ07968 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
F13bQ07968 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
F13bQ07968 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
F13bQ07968 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
F13bQ07968 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
F13bQ07968 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC15.03■□□□□ -0
F13bQ07968 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
F13bQ07968 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
F13bQ07968 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
F13bQ07968 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
F13bQ07968 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
F13bQ07968 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
F13bQ07968 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
F13bQ07968 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
F13bQ07968 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC15.03■□□□□ -0
F13bQ07968 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC15.03■□□□□ -0
F13bQ07968 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
F13bQ07968 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
F13bQ07968 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
F13bQ07968 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
F13bQ07968 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
F13bQ07968 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
F13bQ07968 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
F13bQ07968 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
F13bQ07968 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC15.03■□□□□ -0
F13bQ07968 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
F13bQ07968 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
F13bQ07968 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
F13bQ07968 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
F13bQ07968 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
F13bQ07968 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
F13bQ07968 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
F13bQ07968 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC15.02■□□□□ -0
F13bQ07968 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
F13bQ07968 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
F13bQ07968 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
F13bQ07968 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
F13bQ07968 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
F13bQ07968 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
F13bQ07968 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
F13bQ07968 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
F13bQ07968 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
F13bQ07968 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
F13bQ07968 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
F13bQ07968 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
F13bQ07968 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
F13bQ07968 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
F13bQ07968 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
F13bQ07968 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
F13bQ07968 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
F13bQ07968 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
F13bQ07968 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
F13bQ07968 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
F13bQ07968 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
F13bQ07968 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
F13bQ07968 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
F13bQ07968 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
F13bQ07968 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
F13bQ07968 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
F13bQ07968 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
F13bQ07968 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
F13bQ07968 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
F13bQ07968 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
F13bQ07968 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
F13bQ07968 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
F13bQ07968 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
F13bQ07968 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
F13bQ07968 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
F13bQ07968 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
F13bQ07968 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
F13bQ07968 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
F13bQ07968 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
F13bQ07968 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
F13bQ07968 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
F13bQ07968 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
F13bQ07968 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
F13bQ07968 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
F13bQ07968 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
F13bQ07968 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
F13bQ07968 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
F13bQ07968 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
F13bQ07968 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC15□□□□□ -0.01
F13bQ07968 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms