Protein–RNA interactions for Protein: Q07916

Pou6f1, POU domain, class 6, transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 301 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou6f1Q07916 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pou6f1Q07916 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pou6f1Q07916 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pou6f1Q07916 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Pou6f1Q07916 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pou6f1Q07916 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pou6f1Q07916 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pou6f1Q07916 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pou6f1Q07916 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pou6f1Q07916 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pou6f1Q07916 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pou6f1Q07916 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pou6f1Q07916 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pou6f1Q07916 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pou6f1Q07916 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pou6f1Q07916 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pou6f1Q07916 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pou6f1Q07916 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pou6f1Q07916 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pou6f1Q07916 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pou6f1Q07916 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pou6f1Q07916 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pou6f1Q07916 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pou6f1Q07916 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pou6f1Q07916 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Pou6f1Q07916 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pou6f1Q07916 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pou6f1Q07916 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pou6f1Q07916 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pou6f1Q07916 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Pou6f1Q07916 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pou6f1Q07916 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pou6f1Q07916 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pou6f1Q07916 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pou6f1Q07916 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pou6f1Q07916 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pou6f1Q07916 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pou6f1Q07916 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pou6f1Q07916 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pou6f1Q07916 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pou6f1Q07916 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pou6f1Q07916 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pou6f1Q07916 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pou6f1Q07916 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pou6f1Q07916 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pou6f1Q07916 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pou6f1Q07916 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pou6f1Q07916 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pou6f1Q07916 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Pou6f1Q07916 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pou6f1Q07916 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pou6f1Q07916 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pou6f1Q07916 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pou6f1Q07916 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pou6f1Q07916 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pou6f1Q07916 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pou6f1Q07916 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pou6f1Q07916 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pou6f1Q07916 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pou6f1Q07916 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pou6f1Q07916 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pou6f1Q07916 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pou6f1Q07916 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pou6f1Q07916 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pou6f1Q07916 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pou6f1Q07916 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pou6f1Q07916 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pou6f1Q07916 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pou6f1Q07916 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pou6f1Q07916 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pou6f1Q07916 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pou6f1Q07916 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pou6f1Q07916 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pou6f1Q07916 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pou6f1Q07916 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Pou6f1Q07916 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pou6f1Q07916 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Pou6f1Q07916 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pou6f1Q07916 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pou6f1Q07916 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pou6f1Q07916 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pou6f1Q07916 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pou6f1Q07916 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pou6f1Q07916 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Pou6f1Q07916 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pou6f1Q07916 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Pou6f1Q07916 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pou6f1Q07916 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pou6f1Q07916 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pou6f1Q07916 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pou6f1Q07916 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pou6f1Q07916 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Pou6f1Q07916 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Pou6f1Q07916 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Pou6f1Q07916 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pou6f1Q07916 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pou6f1Q07916 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pou6f1Q07916 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pou6f1Q07916 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Pou6f1Q07916 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms