Protein–RNA interactions for Protein: Q07409

Cntn3, Contactin-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,028 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntn3Q07409 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cntn3Q07409 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cntn3Q07409 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cntn3Q07409 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cntn3Q07409 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cntn3Q07409 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cntn3Q07409 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cntn3Q07409 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cntn3Q07409 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Cntn3Q07409 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cntn3Q07409 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cntn3Q07409 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cntn3Q07409 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cntn3Q07409 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cntn3Q07409 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cntn3Q07409 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cntn3Q07409 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cntn3Q07409 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cntn3Q07409 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cntn3Q07409 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cntn3Q07409 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cntn3Q07409 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cntn3Q07409 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cntn3Q07409 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cntn3Q07409 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cntn3Q07409 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cntn3Q07409 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cntn3Q07409 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Cntn3Q07409 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Cntn3Q07409 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cntn3Q07409 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cntn3Q07409 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cntn3Q07409 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cntn3Q07409 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cntn3Q07409 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cntn3Q07409 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cntn3Q07409 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cntn3Q07409 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cntn3Q07409 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cntn3Q07409 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cntn3Q07409 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cntn3Q07409 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cntn3Q07409 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cntn3Q07409 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cntn3Q07409 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cntn3Q07409 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cntn3Q07409 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cntn3Q07409 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cntn3Q07409 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cntn3Q07409 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cntn3Q07409 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Cntn3Q07409 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cntn3Q07409 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Cntn3Q07409 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cntn3Q07409 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Cntn3Q07409 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cntn3Q07409 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cntn3Q07409 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cntn3Q07409 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cntn3Q07409 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cntn3Q07409 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cntn3Q07409 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cntn3Q07409 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cntn3Q07409 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cntn3Q07409 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cntn3Q07409 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cntn3Q07409 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cntn3Q07409 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cntn3Q07409 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cntn3Q07409 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cntn3Q07409 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cntn3Q07409 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cntn3Q07409 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cntn3Q07409 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cntn3Q07409 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Cntn3Q07409 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cntn3Q07409 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cntn3Q07409 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cntn3Q07409 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cntn3Q07409 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cntn3Q07409 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cntn3Q07409 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cntn3Q07409 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cntn3Q07409 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cntn3Q07409 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cntn3Q07409 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cntn3Q07409 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cntn3Q07409 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Cntn3Q07409 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cntn3Q07409 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Cntn3Q07409 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cntn3Q07409 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cntn3Q07409 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cntn3Q07409 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Cntn3Q07409 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cntn3Q07409 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cntn3Q07409 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cntn3Q07409 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cntn3Q07409 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cntn3Q07409 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms