Protein–RNA interactions for Protein: Q06649

Sh3bp2, SH3 domain-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp2Q06649 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sh3bp2Q06649 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sh3bp2Q06649 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sh3bp2Q06649 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sh3bp2Q06649 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sh3bp2Q06649 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sh3bp2Q06649 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sh3bp2Q06649 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sh3bp2Q06649 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sh3bp2Q06649 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sh3bp2Q06649 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sh3bp2Q06649 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sh3bp2Q06649 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sh3bp2Q06649 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sh3bp2Q06649 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sh3bp2Q06649 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sh3bp2Q06649 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sh3bp2Q06649 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sh3bp2Q06649 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sh3bp2Q06649 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sh3bp2Q06649 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sh3bp2Q06649 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sh3bp2Q06649 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sh3bp2Q06649 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sh3bp2Q06649 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sh3bp2Q06649 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sh3bp2Q06649 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sh3bp2Q06649 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sh3bp2Q06649 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sh3bp2Q06649 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sh3bp2Q06649 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sh3bp2Q06649 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Sh3bp2Q06649 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sh3bp2Q06649 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sh3bp2Q06649 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sh3bp2Q06649 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sh3bp2Q06649 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sh3bp2Q06649 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sh3bp2Q06649 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sh3bp2Q06649 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sh3bp2Q06649 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sh3bp2Q06649 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sh3bp2Q06649 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sh3bp2Q06649 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sh3bp2Q06649 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Sh3bp2Q06649 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sh3bp2Q06649 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Sh3bp2Q06649 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Sh3bp2Q06649 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sh3bp2Q06649 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sh3bp2Q06649 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sh3bp2Q06649 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sh3bp2Q06649 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sh3bp2Q06649 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sh3bp2Q06649 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sh3bp2Q06649 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sh3bp2Q06649 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sh3bp2Q06649 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sh3bp2Q06649 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sh3bp2Q06649 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sh3bp2Q06649 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sh3bp2Q06649 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sh3bp2Q06649 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sh3bp2Q06649 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Sh3bp2Q06649 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Sh3bp2Q06649 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sh3bp2Q06649 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sh3bp2Q06649 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sh3bp2Q06649 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sh3bp2Q06649 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sh3bp2Q06649 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sh3bp2Q06649 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sh3bp2Q06649 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sh3bp2Q06649 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sh3bp2Q06649 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sh3bp2Q06649 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sh3bp2Q06649 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sh3bp2Q06649 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sh3bp2Q06649 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sh3bp2Q06649 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sh3bp2Q06649 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sh3bp2Q06649 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sh3bp2Q06649 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sh3bp2Q06649 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sh3bp2Q06649 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sh3bp2Q06649 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sh3bp2Q06649 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sh3bp2Q06649 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sh3bp2Q06649 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Sh3bp2Q06649 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Sh3bp2Q06649 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Sh3bp2Q06649 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sh3bp2Q06649 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Sh3bp2Q06649 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Sh3bp2Q06649 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sh3bp2Q06649 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sh3bp2Q06649 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sh3bp2Q06649 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sh3bp2Q06649 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sh3bp2Q06649 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.3 ms