Protein–RNA interactions for Protein: Q06507

Atf4, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-4, mousemouse

Predictions only

Length 349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atf4Q06507 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atf4Q06507 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atf4Q06507 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Atf4Q06507 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atf4Q06507 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atf4Q06507 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atf4Q06507 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atf4Q06507 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atf4Q06507 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atf4Q06507 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atf4Q06507 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atf4Q06507 Gm20614-201ENSMUST00000177106 632 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Atf4Q06507 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atf4Q06507 Gm43930-201ENSMUST00000203868 845 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Atf4Q06507 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Atf4Q06507 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atf4Q06507 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atf4Q06507 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atf4Q06507 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atf4Q06507 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atf4Q06507 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Atf4Q06507 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Atf4Q06507 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Atf4Q06507 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Atf4Q06507 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Atf4Q06507 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Atf4Q06507 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Atf4Q06507 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Atf4Q06507 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Atf4Q06507 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Atf4Q06507 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Atf4Q06507 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Atf4Q06507 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Atf4Q06507 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Atf4Q06507 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Atf4Q06507 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Atf4Q06507 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Atf4Q06507 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Atf4Q06507 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atf4Q06507 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atf4Q06507 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atf4Q06507 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atf4Q06507 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Atf4Q06507 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atf4Q06507 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atf4Q06507 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atf4Q06507 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atf4Q06507 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atf4Q06507 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atf4Q06507 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atf4Q06507 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atf4Q06507 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atf4Q06507 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atf4Q06507 1500011K16Rik-201ENSMUST00000135091 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atf4Q06507 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atf4Q06507 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atf4Q06507 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atf4Q06507 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atf4Q06507 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atf4Q06507 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atf4Q06507 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atf4Q06507 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Atf4Q06507 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Atf4Q06507 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Atf4Q06507 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Atf4Q06507 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Atf4Q06507 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Atf4Q06507 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Atf4Q06507 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Atf4Q06507 Gm37102-201ENSMUST00000195740 1105 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Atf4Q06507 Gm31048-201ENSMUST00000196103 1061 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Atf4Q06507 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Atf4Q06507 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Atf4Q06507 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Atf4Q06507 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Atf4Q06507 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Atf4Q06507 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Atf4Q06507 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Atf4Q06507 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Atf4Q06507 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Atf4Q06507 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Atf4Q06507 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Atf4Q06507 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atf4Q06507 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atf4Q06507 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atf4Q06507 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atf4Q06507 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atf4Q06507 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atf4Q06507 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Atf4Q06507 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atf4Q06507 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atf4Q06507 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atf4Q06507 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atf4Q06507 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Atf4Q06507 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Atf4Q06507 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Atf4Q06507 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atf4Q06507 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atf4Q06507 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atf4Q06507 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.8 ms