Protein–RNA interactions for Protein: Q05895

Thbs3, Thrombospondin-3, mousemouse

Predictions only

Length 956 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thbs3Q05895 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Thbs3Q05895 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Thbs3Q05895 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Thbs3Q05895 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Thbs3Q05895 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Thbs3Q05895 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Thbs3Q05895 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Thbs3Q05895 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Thbs3Q05895 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Thbs3Q05895 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Thbs3Q05895 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Thbs3Q05895 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Thbs3Q05895 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Thbs3Q05895 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Thbs3Q05895 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Thbs3Q05895 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Thbs3Q05895 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Thbs3Q05895 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Thbs3Q05895 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Thbs3Q05895 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Thbs3Q05895 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Thbs3Q05895 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Thbs3Q05895 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Thbs3Q05895 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Thbs3Q05895 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Thbs3Q05895 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Thbs3Q05895 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Thbs3Q05895 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Thbs3Q05895 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Thbs3Q05895 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Thbs3Q05895 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Thbs3Q05895 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Thbs3Q05895 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Thbs3Q05895 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Thbs3Q05895 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Thbs3Q05895 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Thbs3Q05895 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Thbs3Q05895 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Thbs3Q05895 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Thbs3Q05895 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Thbs3Q05895 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Thbs3Q05895 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Thbs3Q05895 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Thbs3Q05895 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Thbs3Q05895 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Thbs3Q05895 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Thbs3Q05895 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Thbs3Q05895 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Thbs3Q05895 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Thbs3Q05895 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Thbs3Q05895 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Thbs3Q05895 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Thbs3Q05895 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Thbs3Q05895 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Thbs3Q05895 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Thbs3Q05895 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Thbs3Q05895 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Thbs3Q05895 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Thbs3Q05895 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Thbs3Q05895 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Thbs3Q05895 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Thbs3Q05895 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Thbs3Q05895 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Thbs3Q05895 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Thbs3Q05895 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Thbs3Q05895 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Thbs3Q05895 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Thbs3Q05895 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Thbs3Q05895 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Thbs3Q05895 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Thbs3Q05895 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Thbs3Q05895 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Thbs3Q05895 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Thbs3Q05895 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Thbs3Q05895 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Thbs3Q05895 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Thbs3Q05895 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Thbs3Q05895 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Thbs3Q05895 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Thbs3Q05895 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Thbs3Q05895 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Thbs3Q05895 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Thbs3Q05895 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Thbs3Q05895 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Thbs3Q05895 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Thbs3Q05895 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Thbs3Q05895 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Thbs3Q05895 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Thbs3Q05895 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Thbs3Q05895 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Thbs3Q05895 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Thbs3Q05895 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Thbs3Q05895 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Thbs3Q05895 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Thbs3Q05895 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Thbs3Q05895 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Thbs3Q05895 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Thbs3Q05895 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Thbs3Q05895 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Thbs3Q05895 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms