Protein–RNA interactions for Protein: Q05020

Apoc2, Apolipoprotein C-II, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoc2Q05020 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Apoc2Q05020 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Apoc2Q05020 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Apoc2Q05020 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Apoc2Q05020 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Apoc2Q05020 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Apoc2Q05020 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Apoc2Q05020 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Apoc2Q05020 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Apoc2Q05020 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Apoc2Q05020 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Apoc2Q05020 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Apoc2Q05020 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Apoc2Q05020 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Apoc2Q05020 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Apoc2Q05020 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Apoc2Q05020 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Apoc2Q05020 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Apoc2Q05020 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Apoc2Q05020 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Apoc2Q05020 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Apoc2Q05020 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Apoc2Q05020 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Apoc2Q05020 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Apoc2Q05020 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Apoc2Q05020 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Apoc2Q05020 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Apoc2Q05020 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Apoc2Q05020 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Apoc2Q05020 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Apoc2Q05020 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Apoc2Q05020 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Apoc2Q05020 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Apoc2Q05020 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Apoc2Q05020 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Apoc2Q05020 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Apoc2Q05020 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Apoc2Q05020 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Apoc2Q05020 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Apoc2Q05020 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Apoc2Q05020 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Apoc2Q05020 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Apoc2Q05020 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Apoc2Q05020 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Apoc2Q05020 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Apoc2Q05020 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Apoc2Q05020 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Apoc2Q05020 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Apoc2Q05020 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Apoc2Q05020 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Apoc2Q05020 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Apoc2Q05020 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Apoc2Q05020 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Apoc2Q05020 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Apoc2Q05020 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Apoc2Q05020 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Apoc2Q05020 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Apoc2Q05020 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Apoc2Q05020 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Apoc2Q05020 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Apoc2Q05020 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Apoc2Q05020 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Apoc2Q05020 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Apoc2Q05020 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Apoc2Q05020 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Apoc2Q05020 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Apoc2Q05020 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Apoc2Q05020 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Apoc2Q05020 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Apoc2Q05020 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Apoc2Q05020 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Apoc2Q05020 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Apoc2Q05020 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Apoc2Q05020 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Apoc2Q05020 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Apoc2Q05020 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Apoc2Q05020 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Apoc2Q05020 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Apoc2Q05020 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Apoc2Q05020 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Apoc2Q05020 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Apoc2Q05020 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Apoc2Q05020 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Apoc2Q05020 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Apoc2Q05020 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Apoc2Q05020 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Apoc2Q05020 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Apoc2Q05020 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Apoc2Q05020 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Apoc2Q05020 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Apoc2Q05020 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Apoc2Q05020 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Apoc2Q05020 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Apoc2Q05020 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Apoc2Q05020 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Apoc2Q05020 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Apoc2Q05020 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Apoc2Q05020 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Apoc2Q05020 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Apoc2Q05020 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.4 ms