Protein–RNA interactions for Protein: Q04886

Sox8, Transcription factor SOX-8, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox8Q04886 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sox8Q04886 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sox8Q04886 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sox8Q04886 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sox8Q04886 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sox8Q04886 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sox8Q04886 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sox8Q04886 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sox8Q04886 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sox8Q04886 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sox8Q04886 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sox8Q04886 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sox8Q04886 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sox8Q04886 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sox8Q04886 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Sox8Q04886 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sox8Q04886 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sox8Q04886 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sox8Q04886 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sox8Q04886 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sox8Q04886 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sox8Q04886 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Sox8Q04886 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Sox8Q04886 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Sox8Q04886 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Sox8Q04886 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sox8Q04886 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sox8Q04886 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sox8Q04886 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sox8Q04886 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sox8Q04886 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sox8Q04886 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sox8Q04886 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sox8Q04886 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sox8Q04886 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sox8Q04886 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sox8Q04886 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sox8Q04886 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sox8Q04886 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sox8Q04886 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sox8Q04886 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sox8Q04886 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sox8Q04886 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sox8Q04886 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Sox8Q04886 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Sox8Q04886 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sox8Q04886 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sox8Q04886 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sox8Q04886 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sox8Q04886 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sox8Q04886 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sox8Q04886 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sox8Q04886 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sox8Q04886 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sox8Q04886 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sox8Q04886 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sox8Q04886 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sox8Q04886 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sox8Q04886 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sox8Q04886 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sox8Q04886 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sox8Q04886 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Sox8Q04886 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sox8Q04886 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sox8Q04886 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sox8Q04886 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sox8Q04886 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sox8Q04886 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sox8Q04886 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sox8Q04886 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sox8Q04886 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sox8Q04886 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sox8Q04886 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sox8Q04886 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sox8Q04886 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sox8Q04886 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sox8Q04886 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sox8Q04886 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sox8Q04886 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sox8Q04886 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sox8Q04886 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sox8Q04886 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sox8Q04886 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sox8Q04886 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Sox8Q04886 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sox8Q04886 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sox8Q04886 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sox8Q04886 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sox8Q04886 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sox8Q04886 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sox8Q04886 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sox8Q04886 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sox8Q04886 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sox8Q04886 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sox8Q04886 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sox8Q04886 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sox8Q04886 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sox8Q04886 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sox8Q04886 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Sox8Q04886 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms