Protein–RNA interactions for Protein: Q04750

Top1, DNA topoisomerase 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 767 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top1Q04750 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Top1Q04750 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Top1Q04750 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Top1Q04750 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Top1Q04750 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Top1Q04750 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Top1Q04750 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Top1Q04750 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Top1Q04750 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Top1Q04750 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Top1Q04750 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Top1Q04750 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Top1Q04750 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Top1Q04750 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Top1Q04750 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Top1Q04750 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Top1Q04750 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Top1Q04750 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Top1Q04750 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Top1Q04750 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Top1Q04750 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Top1Q04750 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Top1Q04750 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Top1Q04750 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Top1Q04750 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Top1Q04750 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Top1Q04750 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Top1Q04750 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Top1Q04750 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Top1Q04750 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Top1Q04750 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Top1Q04750 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Top1Q04750 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Top1Q04750 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Top1Q04750 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Top1Q04750 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Top1Q04750 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Top1Q04750 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Top1Q04750 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Top1Q04750 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Top1Q04750 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Top1Q04750 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Top1Q04750 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Top1Q04750 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Top1Q04750 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Top1Q04750 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Top1Q04750 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Top1Q04750 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Top1Q04750 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Top1Q04750 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Top1Q04750 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Top1Q04750 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Top1Q04750 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Top1Q04750 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Top1Q04750 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Top1Q04750 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
Top1Q04750 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Top1Q04750 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Top1Q04750 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Top1Q04750 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Top1Q04750 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Top1Q04750 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Top1Q04750 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Top1Q04750 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Top1Q04750 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Top1Q04750 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Top1Q04750 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Top1Q04750 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Top1Q04750 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Top1Q04750 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Top1Q04750 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Top1Q04750 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Top1Q04750 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Top1Q04750 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Top1Q04750 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Top1Q04750 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Top1Q04750 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Top1Q04750 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Top1Q04750 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Top1Q04750 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Top1Q04750 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Top1Q04750 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Top1Q04750 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Top1Q04750 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Top1Q04750 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Top1Q04750 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Top1Q04750 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Top1Q04750 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Top1Q04750 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Top1Q04750 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Top1Q04750 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Top1Q04750 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Top1Q04750 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Top1Q04750 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Top1Q04750 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Top1Q04750 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Top1Q04750 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Top1Q04750 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Top1Q04750 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Top1Q04750 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms