Protein–RNA interactions for Protein: Q04519

Smpd1, Sphingomyelin phosphodiesterase, mousemouse

Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smpd1Q04519 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Smpd1Q04519 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Smpd1Q04519 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Smpd1Q04519 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Smpd1Q04519 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Smpd1Q04519 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Smpd1Q04519 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Smpd1Q04519 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Smpd1Q04519 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Smpd1Q04519 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Smpd1Q04519 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Smpd1Q04519 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Smpd1Q04519 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Smpd1Q04519 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Smpd1Q04519 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Smpd1Q04519 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Smpd1Q04519 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Smpd1Q04519 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Smpd1Q04519 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Smpd1Q04519 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Smpd1Q04519 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Smpd1Q04519 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Smpd1Q04519 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Smpd1Q04519 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Smpd1Q04519 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Smpd1Q04519 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Smpd1Q04519 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Smpd1Q04519 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Smpd1Q04519 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Smpd1Q04519 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Smpd1Q04519 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Smpd1Q04519 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Smpd1Q04519 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Smpd1Q04519 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Smpd1Q04519 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Smpd1Q04519 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Smpd1Q04519 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Smpd1Q04519 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Smpd1Q04519 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Smpd1Q04519 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Smpd1Q04519 4930412F09Rik-201ENSMUST00000139006 1017 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Smpd1Q04519 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Smpd1Q04519 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Smpd1Q04519 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Smpd1Q04519 Ccl25-201ENSMUST00000024004 1058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Smpd1Q04519 Gm25007-201ENSMUST00000083808 133 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Smpd1Q04519 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Smpd1Q04519 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Smpd1Q04519 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Smpd1Q04519 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Smpd1Q04519 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Smpd1Q04519 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Smpd1Q04519 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Smpd1Q04519 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Smpd1Q04519 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Smpd1Q04519 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Smpd1Q04519 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Smpd1Q04519 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Smpd1Q04519 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Smpd1Q04519 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Smpd1Q04519 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Smpd1Q04519 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Smpd1Q04519 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Smpd1Q04519 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Smpd1Q04519 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Smpd1Q04519 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Smpd1Q04519 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Smpd1Q04519 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Smpd1Q04519 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Smpd1Q04519 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Smpd1Q04519 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Smpd1Q04519 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Smpd1Q04519 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Smpd1Q04519 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Smpd1Q04519 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Smpd1Q04519 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Smpd1Q04519 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Smpd1Q04519 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Smpd1Q04519 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Smpd1Q04519 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Smpd1Q04519 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Smpd1Q04519 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Smpd1Q04519 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Smpd1Q04519 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Smpd1Q04519 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Smpd1Q04519 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Smpd1Q04519 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Smpd1Q04519 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Smpd1Q04519 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Smpd1Q04519 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Smpd1Q04519 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Smpd1Q04519 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Smpd1Q04519 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Smpd1Q04519 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Smpd1Q04519 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Smpd1Q04519 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Smpd1Q04519 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Smpd1Q04519 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Smpd1Q04519 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Smpd1Q04519 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms