Protein–RNA interactions for Protein: Q04207

Rela, Transcription factor p65, mousemouse

Predictions only

Length 549 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RelaQ04207 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
RelaQ04207 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
RelaQ04207 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RelaQ04207 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RelaQ04207 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RelaQ04207 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RelaQ04207 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RelaQ04207 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RelaQ04207 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RelaQ04207 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RelaQ04207 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RelaQ04207 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RelaQ04207 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RelaQ04207 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RelaQ04207 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RelaQ04207 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RelaQ04207 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RelaQ04207 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RelaQ04207 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RelaQ04207 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RelaQ04207 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RelaQ04207 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RelaQ04207 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
RelaQ04207 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
RelaQ04207 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RelaQ04207 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RelaQ04207 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RelaQ04207 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RelaQ04207 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RelaQ04207 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
RelaQ04207 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RelaQ04207 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RelaQ04207 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RelaQ04207 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RelaQ04207 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RelaQ04207 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RelaQ04207 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RelaQ04207 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RelaQ04207 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RelaQ04207 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RelaQ04207 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RelaQ04207 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RelaQ04207 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RelaQ04207 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RelaQ04207 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RelaQ04207 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RelaQ04207 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RelaQ04207 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RelaQ04207 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RelaQ04207 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RelaQ04207 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RelaQ04207 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RelaQ04207 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RelaQ04207 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RelaQ04207 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RelaQ04207 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RelaQ04207 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
RelaQ04207 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RelaQ04207 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RelaQ04207 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RelaQ04207 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
RelaQ04207 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RelaQ04207 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RelaQ04207 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RelaQ04207 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RelaQ04207 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RelaQ04207 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RelaQ04207 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RelaQ04207 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RelaQ04207 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RelaQ04207 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RelaQ04207 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RelaQ04207 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RelaQ04207 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RelaQ04207 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RelaQ04207 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RelaQ04207 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RelaQ04207 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RelaQ04207 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
RelaQ04207 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RelaQ04207 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RelaQ04207 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RelaQ04207 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RelaQ04207 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RelaQ04207 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RelaQ04207 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RelaQ04207 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RelaQ04207 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RelaQ04207 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RelaQ04207 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RelaQ04207 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RelaQ04207 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RelaQ04207 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RelaQ04207 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RelaQ04207 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RelaQ04207 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RelaQ04207 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RelaQ04207 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RelaQ04207 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RelaQ04207 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms