Protein–RNA interactions for Protein: Q03404

Tff2, Trefoil factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tff2Q03404 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Tff2Q03404 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Tff2Q03404 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Tff2Q03404 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Tff2Q03404 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Tff2Q03404 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Tff2Q03404 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Tff2Q03404 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Tff2Q03404 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Tff2Q03404 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Tff2Q03404 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Tff2Q03404 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Tff2Q03404 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Tff2Q03404 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Tff2Q03404 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Tff2Q03404 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Tff2Q03404 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Tff2Q03404 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Tff2Q03404 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Tff2Q03404 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Tff2Q03404 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Tff2Q03404 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Tff2Q03404 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Tff2Q03404 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Tff2Q03404 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Tff2Q03404 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Tff2Q03404 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Tff2Q03404 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Tff2Q03404 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Tff2Q03404 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Tff2Q03404 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Tff2Q03404 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Tff2Q03404 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Tff2Q03404 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Tff2Q03404 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Tff2Q03404 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Tff2Q03404 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Tff2Q03404 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Tff2Q03404 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Tff2Q03404 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Tff2Q03404 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Tff2Q03404 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Tff2Q03404 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Tff2Q03404 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Tff2Q03404 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Tff2Q03404 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Tff2Q03404 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Tff2Q03404 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Tff2Q03404 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Tff2Q03404 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tff2Q03404 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tff2Q03404 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tff2Q03404 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tff2Q03404 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Tff2Q03404 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Tff2Q03404 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tff2Q03404 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tff2Q03404 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tff2Q03404 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tff2Q03404 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tff2Q03404 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tff2Q03404 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tff2Q03404 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tff2Q03404 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tff2Q03404 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Tff2Q03404 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tff2Q03404 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tff2Q03404 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tff2Q03404 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tff2Q03404 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tff2Q03404 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tff2Q03404 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tff2Q03404 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Tff2Q03404 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tff2Q03404 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tff2Q03404 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tff2Q03404 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tff2Q03404 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tff2Q03404 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tff2Q03404 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tff2Q03404 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tff2Q03404 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tff2Q03404 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tff2Q03404 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tff2Q03404 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tff2Q03404 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Tff2Q03404 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tff2Q03404 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tff2Q03404 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tff2Q03404 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tff2Q03404 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tff2Q03404 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tff2Q03404 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tff2Q03404 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tff2Q03404 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tff2Q03404 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tff2Q03404 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tff2Q03404 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tff2Q03404 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tff2Q03404 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms