Protein–RNA interactions for Protein: Q03358

Msx2, Homeobox protein MSX-2, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msx2Q03358 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Msx2Q03358 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Msx2Q03358 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Msx2Q03358 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Msx2Q03358 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Msx2Q03358 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Msx2Q03358 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Msx2Q03358 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Msx2Q03358 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Msx2Q03358 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Msx2Q03358 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Msx2Q03358 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Msx2Q03358 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Msx2Q03358 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Msx2Q03358 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Msx2Q03358 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Msx2Q03358 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Msx2Q03358 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Msx2Q03358 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Msx2Q03358 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Msx2Q03358 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Msx2Q03358 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Msx2Q03358 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Msx2Q03358 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Msx2Q03358 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Msx2Q03358 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Msx2Q03358 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Msx2Q03358 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Msx2Q03358 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Msx2Q03358 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Msx2Q03358 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Msx2Q03358 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Msx2Q03358 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Msx2Q03358 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Msx2Q03358 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Msx2Q03358 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Msx2Q03358 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Msx2Q03358 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Msx2Q03358 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Msx2Q03358 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Msx2Q03358 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Msx2Q03358 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Msx2Q03358 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Msx2Q03358 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Msx2Q03358 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Msx2Q03358 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Msx2Q03358 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Msx2Q03358 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Msx2Q03358 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Msx2Q03358 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Msx2Q03358 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Msx2Q03358 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Msx2Q03358 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Msx2Q03358 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Msx2Q03358 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Msx2Q03358 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Msx2Q03358 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Msx2Q03358 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Msx2Q03358 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Msx2Q03358 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Msx2Q03358 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Msx2Q03358 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Msx2Q03358 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Msx2Q03358 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Msx2Q03358 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Msx2Q03358 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Msx2Q03358 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Msx2Q03358 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Msx2Q03358 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Msx2Q03358 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Msx2Q03358 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Msx2Q03358 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Msx2Q03358 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Msx2Q03358 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Msx2Q03358 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Msx2Q03358 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Msx2Q03358 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Msx2Q03358 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Msx2Q03358 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Msx2Q03358 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Msx2Q03358 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Msx2Q03358 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Msx2Q03358 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Msx2Q03358 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Msx2Q03358 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Msx2Q03358 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Msx2Q03358 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Msx2Q03358 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Msx2Q03358 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Msx2Q03358 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Msx2Q03358 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Msx2Q03358 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Msx2Q03358 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Msx2Q03358 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Msx2Q03358 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Msx2Q03358 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Msx2Q03358 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Msx2Q03358 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Msx2Q03358 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Msx2Q03358 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.8 ms