Protein–RNA interactions for Protein: Q03350

Thbs2, Thrombospondin-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thbs2Q03350 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Thbs2Q03350 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Thbs2Q03350 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Thbs2Q03350 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Thbs2Q03350 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Thbs2Q03350 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Thbs2Q03350 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Thbs2Q03350 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Thbs2Q03350 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Thbs2Q03350 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Thbs2Q03350 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Thbs2Q03350 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Thbs2Q03350 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Thbs2Q03350 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Thbs2Q03350 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Thbs2Q03350 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Thbs2Q03350 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Thbs2Q03350 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Thbs2Q03350 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Thbs2Q03350 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Thbs2Q03350 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Thbs2Q03350 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Thbs2Q03350 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Thbs2Q03350 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Thbs2Q03350 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Thbs2Q03350 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Thbs2Q03350 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Thbs2Q03350 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Thbs2Q03350 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Thbs2Q03350 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Thbs2Q03350 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Thbs2Q03350 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Thbs2Q03350 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Thbs2Q03350 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Thbs2Q03350 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Thbs2Q03350 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Thbs2Q03350 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Thbs2Q03350 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Thbs2Q03350 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Thbs2Q03350 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Thbs2Q03350 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Thbs2Q03350 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Thbs2Q03350 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Thbs2Q03350 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Thbs2Q03350 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Thbs2Q03350 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Thbs2Q03350 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Thbs2Q03350 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Thbs2Q03350 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Thbs2Q03350 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Thbs2Q03350 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Thbs2Q03350 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Thbs2Q03350 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Thbs2Q03350 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Thbs2Q03350 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Thbs2Q03350 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Thbs2Q03350 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Thbs2Q03350 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Thbs2Q03350 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Thbs2Q03350 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Thbs2Q03350 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Thbs2Q03350 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Thbs2Q03350 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Thbs2Q03350 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Thbs2Q03350 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Thbs2Q03350 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Thbs2Q03350 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Thbs2Q03350 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Thbs2Q03350 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Thbs2Q03350 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Thbs2Q03350 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Thbs2Q03350 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Thbs2Q03350 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Thbs2Q03350 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Thbs2Q03350 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Thbs2Q03350 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Thbs2Q03350 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Thbs2Q03350 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Thbs2Q03350 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Thbs2Q03350 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Thbs2Q03350 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Thbs2Q03350 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Thbs2Q03350 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Thbs2Q03350 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Thbs2Q03350 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Thbs2Q03350 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Thbs2Q03350 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Thbs2Q03350 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Thbs2Q03350 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Thbs2Q03350 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Thbs2Q03350 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Thbs2Q03350 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Thbs2Q03350 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Thbs2Q03350 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Thbs2Q03350 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Thbs2Q03350 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Thbs2Q03350 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Thbs2Q03350 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Thbs2Q03350 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Thbs2Q03350 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.1 ms