Protein–RNA interactions for Protein: Q02853

Mmp11, Stromelysin-3, mousemouse

Predictions only

Length 492 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp11Q02853 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Mmp11Q02853 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Mmp11Q02853 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Mmp11Q02853 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Mmp11Q02853 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Mmp11Q02853 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Mmp11Q02853 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Mmp11Q02853 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Mmp11Q02853 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Mmp11Q02853 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Mmp11Q02853 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Mmp11Q02853 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Mmp11Q02853 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Mmp11Q02853 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Mmp11Q02853 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Mmp11Q02853 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Mmp11Q02853 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Mmp11Q02853 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Mmp11Q02853 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Mmp11Q02853 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Mmp11Q02853 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Mmp11Q02853 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Mmp11Q02853 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Mmp11Q02853 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Mmp11Q02853 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Mmp11Q02853 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Mmp11Q02853 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Mmp11Q02853 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Mmp11Q02853 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Mmp11Q02853 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Mmp11Q02853 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Mmp11Q02853 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Mmp11Q02853 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Mmp11Q02853 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Mmp11Q02853 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Mmp11Q02853 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Mmp11Q02853 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Mmp11Q02853 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Mmp11Q02853 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Mmp11Q02853 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Mmp11Q02853 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Mmp11Q02853 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Mmp11Q02853 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Mmp11Q02853 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Mmp11Q02853 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Mmp11Q02853 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Mmp11Q02853 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Mmp11Q02853 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Mmp11Q02853 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Mmp11Q02853 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Mmp11Q02853 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Mmp11Q02853 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Mmp11Q02853 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Mmp11Q02853 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Mmp11Q02853 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Mmp11Q02853 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Mmp11Q02853 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Mmp11Q02853 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Mmp11Q02853 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Mmp11Q02853 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Mmp11Q02853 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Mmp11Q02853 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Mmp11Q02853 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Mmp11Q02853 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Mmp11Q02853 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Mmp11Q02853 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Mmp11Q02853 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Mmp11Q02853 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Mmp11Q02853 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Mmp11Q02853 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Mmp11Q02853 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Mmp11Q02853 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Mmp11Q02853 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Mmp11Q02853 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Mmp11Q02853 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Mmp11Q02853 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Mmp11Q02853 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Mmp11Q02853 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Mmp11Q02853 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Mmp11Q02853 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Mmp11Q02853 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Mmp11Q02853 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Mmp11Q02853 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Mmp11Q02853 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Mmp11Q02853 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Mmp11Q02853 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Mmp11Q02853 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Mmp11Q02853 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Mmp11Q02853 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Mmp11Q02853 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Mmp11Q02853 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Mmp11Q02853 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Mmp11Q02853 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Mmp11Q02853 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Mmp11Q02853 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Mmp11Q02853 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Mmp11Q02853 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Mmp11Q02853 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Mmp11Q02853 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Mmp11Q02853 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms