Protein–RNA interactions for Protein: Q02788

Col6a2, Collagen alpha-2(VI) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,034 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col6a2Q02788 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Col6a2Q02788 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Col6a2Q02788 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Col6a2Q02788 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Col6a2Q02788 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Col6a2Q02788 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Col6a2Q02788 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Col6a2Q02788 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Col6a2Q02788 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Col6a2Q02788 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Col6a2Q02788 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Col6a2Q02788 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Col6a2Q02788 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Col6a2Q02788 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Col6a2Q02788 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Col6a2Q02788 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Col6a2Q02788 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Col6a2Q02788 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Col6a2Q02788 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Col6a2Q02788 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Col6a2Q02788 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Col6a2Q02788 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Col6a2Q02788 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Col6a2Q02788 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Col6a2Q02788 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Col6a2Q02788 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Col6a2Q02788 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Col6a2Q02788 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Col6a2Q02788 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Col6a2Q02788 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Col6a2Q02788 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Col6a2Q02788 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Col6a2Q02788 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Col6a2Q02788 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Col6a2Q02788 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Col6a2Q02788 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Col6a2Q02788 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Col6a2Q02788 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Col6a2Q02788 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Col6a2Q02788 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Col6a2Q02788 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Col6a2Q02788 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Col6a2Q02788 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Col6a2Q02788 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Col6a2Q02788 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Col6a2Q02788 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Col6a2Q02788 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Col6a2Q02788 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Col6a2Q02788 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Col6a2Q02788 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Col6a2Q02788 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Col6a2Q02788 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Col6a2Q02788 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Col6a2Q02788 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Col6a2Q02788 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Col6a2Q02788 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Col6a2Q02788 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Col6a2Q02788 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Col6a2Q02788 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Col6a2Q02788 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Col6a2Q02788 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Col6a2Q02788 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Col6a2Q02788 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Col6a2Q02788 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Col6a2Q02788 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Col6a2Q02788 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Col6a2Q02788 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Col6a2Q02788 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Col6a2Q02788 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Col6a2Q02788 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Col6a2Q02788 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Col6a2Q02788 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Col6a2Q02788 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Col6a2Q02788 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Col6a2Q02788 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Col6a2Q02788 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Col6a2Q02788 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Col6a2Q02788 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Col6a2Q02788 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Col6a2Q02788 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Col6a2Q02788 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Col6a2Q02788 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Col6a2Q02788 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Col6a2Q02788 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Col6a2Q02788 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Col6a2Q02788 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Col6a2Q02788 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Col6a2Q02788 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Col6a2Q02788 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Col6a2Q02788 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Col6a2Q02788 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Col6a2Q02788 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Col6a2Q02788 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Col6a2Q02788 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Col6a2Q02788 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Col6a2Q02788 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Col6a2Q02788 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Col6a2Q02788 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Col6a2Q02788 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Col6a2Q02788 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 95.2 ms