Protein–RNA interactions for Protein: Q02067

Ascl1, Achaete-scute homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 231 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ascl1Q02067 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ascl1Q02067 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ascl1Q02067 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ascl1Q02067 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ascl1Q02067 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ascl1Q02067 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ascl1Q02067 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ascl1Q02067 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ascl1Q02067 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ascl1Q02067 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ascl1Q02067 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ascl1Q02067 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ascl1Q02067 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ascl1Q02067 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ascl1Q02067 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ascl1Q02067 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ascl1Q02067 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ascl1Q02067 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ascl1Q02067 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ascl1Q02067 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ascl1Q02067 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ascl1Q02067 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ascl1Q02067 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ascl1Q02067 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ascl1Q02067 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ascl1Q02067 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ascl1Q02067 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ascl1Q02067 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ascl1Q02067 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ascl1Q02067 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ascl1Q02067 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ascl1Q02067 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Ascl1Q02067 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ascl1Q02067 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ascl1Q02067 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ascl1Q02067 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Ascl1Q02067 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ascl1Q02067 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ascl1Q02067 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ascl1Q02067 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ascl1Q02067 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ascl1Q02067 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ascl1Q02067 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ascl1Q02067 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ascl1Q02067 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ascl1Q02067 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ascl1Q02067 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ascl1Q02067 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ascl1Q02067 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ascl1Q02067 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ascl1Q02067 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ascl1Q02067 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ascl1Q02067 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Ascl1Q02067 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ascl1Q02067 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Ascl1Q02067 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ascl1Q02067 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ascl1Q02067 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ascl1Q02067 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ascl1Q02067 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ascl1Q02067 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ascl1Q02067 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ascl1Q02067 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ascl1Q02067 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ascl1Q02067 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ascl1Q02067 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ascl1Q02067 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ascl1Q02067 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ascl1Q02067 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Ascl1Q02067 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ascl1Q02067 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ascl1Q02067 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ascl1Q02067 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ascl1Q02067 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Ascl1Q02067 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ascl1Q02067 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ascl1Q02067 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ascl1Q02067 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ascl1Q02067 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ascl1Q02067 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ascl1Q02067 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ascl1Q02067 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ascl1Q02067 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ascl1Q02067 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ascl1Q02067 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Ascl1Q02067 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ascl1Q02067 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Ascl1Q02067 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ascl1Q02067 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ascl1Q02067 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ascl1Q02067 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ascl1Q02067 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ascl1Q02067 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ascl1Q02067 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ascl1Q02067 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ascl1Q02067 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ascl1Q02067 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ascl1Q02067 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ascl1Q02067 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ascl1Q02067 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms