Protein–RNA interactions for Protein: Q01815

Cacna1c, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1C, mousemouse

Predictions only

Length 2,139 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna1cQ01815 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cacna1cQ01815 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Cacna1cQ01815 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Cacna1cQ01815 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Cacna1cQ01815 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cacna1cQ01815 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Cacna1cQ01815 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cacna1cQ01815 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cacna1cQ01815 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Cacna1cQ01815 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cacna1cQ01815 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cacna1cQ01815 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cacna1cQ01815 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cacna1cQ01815 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cacna1cQ01815 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cacna1cQ01815 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cacna1cQ01815 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cacna1cQ01815 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cacna1cQ01815 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cacna1cQ01815 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cacna1cQ01815 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cacna1cQ01815 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cacna1cQ01815 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cacna1cQ01815 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cacna1cQ01815 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Cacna1cQ01815 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cacna1cQ01815 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cacna1cQ01815 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cacna1cQ01815 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cacna1cQ01815 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cacna1cQ01815 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cacna1cQ01815 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cacna1cQ01815 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cacna1cQ01815 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cacna1cQ01815 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cacna1cQ01815 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cacna1cQ01815 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cacna1cQ01815 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cacna1cQ01815 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Cacna1cQ01815 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Cacna1cQ01815 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Cacna1cQ01815 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cacna1cQ01815 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cacna1cQ01815 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cacna1cQ01815 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Cacna1cQ01815 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Cacna1cQ01815 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Cacna1cQ01815 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cacna1cQ01815 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cacna1cQ01815 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cacna1cQ01815 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Cacna1cQ01815 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cacna1cQ01815 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cacna1cQ01815 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cacna1cQ01815 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cacna1cQ01815 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cacna1cQ01815 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cacna1cQ01815 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cacna1cQ01815 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cacna1cQ01815 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cacna1cQ01815 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cacna1cQ01815 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Cacna1cQ01815 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Cacna1cQ01815 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cacna1cQ01815 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cacna1cQ01815 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cacna1cQ01815 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cacna1cQ01815 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cacna1cQ01815 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cacna1cQ01815 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cacna1cQ01815 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cacna1cQ01815 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Cacna1cQ01815 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Cacna1cQ01815 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cacna1cQ01815 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cacna1cQ01815 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cacna1cQ01815 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cacna1cQ01815 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cacna1cQ01815 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cacna1cQ01815 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Cacna1cQ01815 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Cacna1cQ01815 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Cacna1cQ01815 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Cacna1cQ01815 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Cacna1cQ01815 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cacna1cQ01815 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cacna1cQ01815 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cacna1cQ01815 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cacna1cQ01815 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cacna1cQ01815 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cacna1cQ01815 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cacna1cQ01815 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cacna1cQ01815 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cacna1cQ01815 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cacna1cQ01815 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cacna1cQ01815 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cacna1cQ01815 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cacna1cQ01815 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cacna1cQ01815 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cacna1cQ01815 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms