Protein–RNA interactions for Protein: Q01279

Egfr, Epidermal growth factor receptor, mousemouse

Predictions only

Length 1,210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EgfrQ01279 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
EgfrQ01279 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
EgfrQ01279 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
EgfrQ01279 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
EgfrQ01279 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
EgfrQ01279 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
EgfrQ01279 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
EgfrQ01279 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
EgfrQ01279 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
EgfrQ01279 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
EgfrQ01279 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
EgfrQ01279 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
EgfrQ01279 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
EgfrQ01279 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
EgfrQ01279 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
EgfrQ01279 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
EgfrQ01279 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
EgfrQ01279 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
EgfrQ01279 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
EgfrQ01279 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
EgfrQ01279 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
EgfrQ01279 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
EgfrQ01279 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
EgfrQ01279 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
EgfrQ01279 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
EgfrQ01279 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
EgfrQ01279 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
EgfrQ01279 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
EgfrQ01279 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
EgfrQ01279 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
EgfrQ01279 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
EgfrQ01279 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
EgfrQ01279 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
EgfrQ01279 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
EgfrQ01279 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
EgfrQ01279 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
EgfrQ01279 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
EgfrQ01279 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
EgfrQ01279 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
EgfrQ01279 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
EgfrQ01279 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
EgfrQ01279 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
EgfrQ01279 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
EgfrQ01279 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
EgfrQ01279 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
EgfrQ01279 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
EgfrQ01279 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
EgfrQ01279 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
EgfrQ01279 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
EgfrQ01279 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
EgfrQ01279 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
EgfrQ01279 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
EgfrQ01279 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
EgfrQ01279 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
EgfrQ01279 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
EgfrQ01279 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
EgfrQ01279 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
EgfrQ01279 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
EgfrQ01279 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
EgfrQ01279 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
EgfrQ01279 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
EgfrQ01279 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
EgfrQ01279 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
EgfrQ01279 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
EgfrQ01279 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
EgfrQ01279 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
EgfrQ01279 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
EgfrQ01279 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
EgfrQ01279 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
EgfrQ01279 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
EgfrQ01279 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
EgfrQ01279 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
EgfrQ01279 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
EgfrQ01279 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
EgfrQ01279 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
EgfrQ01279 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
EgfrQ01279 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
EgfrQ01279 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
EgfrQ01279 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
EgfrQ01279 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
EgfrQ01279 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
EgfrQ01279 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
EgfrQ01279 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
EgfrQ01279 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
EgfrQ01279 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
EgfrQ01279 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
EgfrQ01279 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
EgfrQ01279 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
EgfrQ01279 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
EgfrQ01279 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
EgfrQ01279 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
EgfrQ01279 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
EgfrQ01279 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
EgfrQ01279 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
EgfrQ01279 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
EgfrQ01279 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
EgfrQ01279 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
EgfrQ01279 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
EgfrQ01279 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
EgfrQ01279 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms