Protein–RNA interactions for Protein: Q01231

Gja5, Gap junction alpha-5 protein, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gja5Q01231 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Gja5Q01231 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Gja5Q01231 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Gja5Q01231 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Gja5Q01231 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Gja5Q01231 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Gja5Q01231 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Gja5Q01231 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Gja5Q01231 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Gja5Q01231 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Gja5Q01231 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Gja5Q01231 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
Gja5Q01231 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Gja5Q01231 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Gja5Q01231 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Gja5Q01231 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Gja5Q01231 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Gja5Q01231 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
Gja5Q01231 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Gja5Q01231 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Gja5Q01231 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Gja5Q01231 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Gja5Q01231 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Gja5Q01231 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Gja5Q01231 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Gja5Q01231 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Gja5Q01231 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Gja5Q01231 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Gja5Q01231 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Gja5Q01231 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Gja5Q01231 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Gja5Q01231 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Gja5Q01231 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Gja5Q01231 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
Gja5Q01231 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC20.89■□□□□ 0.94
Gja5Q01231 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Gja5Q01231 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Gja5Q01231 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Gja5Q01231 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Gja5Q01231 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Gja5Q01231 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
Gja5Q01231 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Gja5Q01231 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
Gja5Q01231 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Gja5Q01231 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Gja5Q01231 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Gja5Q01231 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
Gja5Q01231 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Gja5Q01231 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Gja5Q01231 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Gja5Q01231 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Gja5Q01231 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Gja5Q01231 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Gja5Q01231 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
Gja5Q01231 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
Gja5Q01231 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Gja5Q01231 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Gja5Q01231 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Gja5Q01231 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Gja5Q01231 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Gja5Q01231 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Gja5Q01231 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Gja5Q01231 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Gja5Q01231 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Gja5Q01231 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Gja5Q01231 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Gja5Q01231 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
Gja5Q01231 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Gja5Q01231 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
Gja5Q01231 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
Gja5Q01231 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Gja5Q01231 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Gja5Q01231 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Gja5Q01231 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
Gja5Q01231 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Gja5Q01231 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Gja5Q01231 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Gja5Q01231 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Gja5Q01231 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Gja5Q01231 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Gja5Q01231 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Gja5Q01231 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Gja5Q01231 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Gja5Q01231 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Gja5Q01231 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Gja5Q01231 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Gja5Q01231 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Gja5Q01231 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Gja5Q01231 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Gja5Q01231 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Gja5Q01231 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Gja5Q01231 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Gja5Q01231 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Gja5Q01231 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Gja5Q01231 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Gja5Q01231 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Gja5Q01231 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Gja5Q01231 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Gja5Q01231 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Gja5Q01231 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.7 ms