Protein–RNA interactions for Protein: Q01098

Grin2c, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2C, mousemouse

Predictions only

Length 1,239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin2cQ01098 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Grin2cQ01098 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Grin2cQ01098 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Grin2cQ01098 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Grin2cQ01098 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Grin2cQ01098 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Grin2cQ01098 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Grin2cQ01098 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Grin2cQ01098 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Grin2cQ01098 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Grin2cQ01098 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Grin2cQ01098 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Grin2cQ01098 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Grin2cQ01098 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Grin2cQ01098 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Grin2cQ01098 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Grin2cQ01098 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Grin2cQ01098 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Grin2cQ01098 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Grin2cQ01098 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Grin2cQ01098 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Grin2cQ01098 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Grin2cQ01098 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Grin2cQ01098 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Grin2cQ01098 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Grin2cQ01098 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Grin2cQ01098 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Grin2cQ01098 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Grin2cQ01098 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Grin2cQ01098 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Grin2cQ01098 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Grin2cQ01098 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Grin2cQ01098 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Grin2cQ01098 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Grin2cQ01098 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Grin2cQ01098 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Grin2cQ01098 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Grin2cQ01098 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Grin2cQ01098 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Grin2cQ01098 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Grin2cQ01098 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Grin2cQ01098 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Grin2cQ01098 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Grin2cQ01098 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Grin2cQ01098 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Grin2cQ01098 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Grin2cQ01098 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Grin2cQ01098 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Grin2cQ01098 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Grin2cQ01098 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Grin2cQ01098 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Grin2cQ01098 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Grin2cQ01098 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Grin2cQ01098 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Grin2cQ01098 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Grin2cQ01098 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Grin2cQ01098 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Grin2cQ01098 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Grin2cQ01098 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Grin2cQ01098 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Grin2cQ01098 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Grin2cQ01098 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Grin2cQ01098 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Grin2cQ01098 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Grin2cQ01098 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Grin2cQ01098 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Grin2cQ01098 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Grin2cQ01098 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Grin2cQ01098 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Grin2cQ01098 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Grin2cQ01098 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Grin2cQ01098 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Grin2cQ01098 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Grin2cQ01098 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Grin2cQ01098 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Grin2cQ01098 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Grin2cQ01098 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Grin2cQ01098 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Grin2cQ01098 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Grin2cQ01098 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Grin2cQ01098 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Grin2cQ01098 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Grin2cQ01098 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Grin2cQ01098 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Grin2cQ01098 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Grin2cQ01098 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Grin2cQ01098 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Grin2cQ01098 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Grin2cQ01098 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Grin2cQ01098 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Grin2cQ01098 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Grin2cQ01098 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Grin2cQ01098 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Grin2cQ01098 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Grin2cQ01098 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Grin2cQ01098 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Grin2cQ01098 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Grin2cQ01098 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Grin2cQ01098 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Grin2cQ01098 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms