Protein–RNA interactions for Protein: Q01097

Grin2b, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2B, mousemouse

Predictions only

Length 1,482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin2bQ01097 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC27.89■■■□□ 2.05
Grin2bQ01097 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Grin2bQ01097 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Grin2bQ01097 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Grin2bQ01097 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Grin2bQ01097 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Grin2bQ01097 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Grin2bQ01097 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Grin2bQ01097 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Grin2bQ01097 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Grin2bQ01097 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Grin2bQ01097 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Grin2bQ01097 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
Grin2bQ01097 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Grin2bQ01097 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Grin2bQ01097 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Grin2bQ01097 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Grin2bQ01097 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Grin2bQ01097 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Grin2bQ01097 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Grin2bQ01097 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Grin2bQ01097 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Grin2bQ01097 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Grin2bQ01097 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Grin2bQ01097 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Grin2bQ01097 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Grin2bQ01097 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
Grin2bQ01097 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Grin2bQ01097 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Grin2bQ01097 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Grin2bQ01097 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Grin2bQ01097 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Grin2bQ01097 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
Grin2bQ01097 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Grin2bQ01097 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Grin2bQ01097 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Grin2bQ01097 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Grin2bQ01097 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Grin2bQ01097 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Grin2bQ01097 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
Grin2bQ01097 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Grin2bQ01097 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Grin2bQ01097 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Grin2bQ01097 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Grin2bQ01097 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Grin2bQ01097 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Grin2bQ01097 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Grin2bQ01097 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Grin2bQ01097 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Grin2bQ01097 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Grin2bQ01097 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Grin2bQ01097 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Grin2bQ01097 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Grin2bQ01097 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Grin2bQ01097 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Grin2bQ01097 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Grin2bQ01097 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Grin2bQ01097 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
Grin2bQ01097 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
Grin2bQ01097 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.04
Grin2bQ01097 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Grin2bQ01097 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Grin2bQ01097 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Grin2bQ01097 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Grin2bQ01097 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Grin2bQ01097 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Grin2bQ01097 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Grin2bQ01097 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Grin2bQ01097 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Grin2bQ01097 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Grin2bQ01097 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Grin2bQ01097 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Grin2bQ01097 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Grin2bQ01097 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Grin2bQ01097 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Grin2bQ01097 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Grin2bQ01097 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Grin2bQ01097 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Grin2bQ01097 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Grin2bQ01097 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Grin2bQ01097 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Grin2bQ01097 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Grin2bQ01097 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Grin2bQ01097 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Grin2bQ01097 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Grin2bQ01097 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Grin2bQ01097 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Grin2bQ01097 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Grin2bQ01097 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Grin2bQ01097 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Grin2bQ01097 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Grin2bQ01097 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Grin2bQ01097 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Grin2bQ01097 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Grin2bQ01097 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Grin2bQ01097 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
Grin2bQ01097 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Grin2bQ01097 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
Grin2bQ01097 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Grin2bQ01097 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms