Protein–RNA interactions for Protein: Q00977

Gjb2, Gap junction beta-2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb2Q00977 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Gjb2Q00977 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Gjb2Q00977 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Gjb2Q00977 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Gjb2Q00977 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Gjb2Q00977 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Gjb2Q00977 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Gjb2Q00977 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Gjb2Q00977 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Gjb2Q00977 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Gjb2Q00977 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
Gjb2Q00977 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Gjb2Q00977 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Gjb2Q00977 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Gjb2Q00977 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Gjb2Q00977 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Gjb2Q00977 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Gjb2Q00977 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Gjb2Q00977 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Gjb2Q00977 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Gjb2Q00977 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Gjb2Q00977 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Gjb2Q00977 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Gjb2Q00977 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Gjb2Q00977 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Gjb2Q00977 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Gjb2Q00977 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Gjb2Q00977 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Gjb2Q00977 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Gjb2Q00977 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Gjb2Q00977 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Gjb2Q00977 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Gjb2Q00977 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Gjb2Q00977 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Gjb2Q00977 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Gjb2Q00977 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Gjb2Q00977 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Gjb2Q00977 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Gjb2Q00977 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Gjb2Q00977 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Gjb2Q00977 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Gjb2Q00977 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Gjb2Q00977 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Gjb2Q00977 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Gjb2Q00977 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Gjb2Q00977 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Gjb2Q00977 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Gjb2Q00977 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Gjb2Q00977 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Gjb2Q00977 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Gjb2Q00977 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Gjb2Q00977 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Gjb2Q00977 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Gjb2Q00977 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Gjb2Q00977 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Gjb2Q00977 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gjb2Q00977 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gjb2Q00977 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gjb2Q00977 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gjb2Q00977 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gjb2Q00977 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gjb2Q00977 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gjb2Q00977 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gjb2Q00977 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gjb2Q00977 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gjb2Q00977 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gjb2Q00977 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gjb2Q00977 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gjb2Q00977 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gjb2Q00977 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gjb2Q00977 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gjb2Q00977 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gjb2Q00977 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gjb2Q00977 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gjb2Q00977 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gjb2Q00977 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gjb2Q00977 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gjb2Q00977 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gjb2Q00977 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gjb2Q00977 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gjb2Q00977 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Gjb2Q00977 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Gjb2Q00977 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gjb2Q00977 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Gjb2Q00977 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gjb2Q00977 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gjb2Q00977 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gjb2Q00977 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gjb2Q00977 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Gjb2Q00977 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Gjb2Q00977 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Gjb2Q00977 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Gjb2Q00977 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Gjb2Q00977 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Gjb2Q00977 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Gjb2Q00977 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Gjb2Q00977 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Gjb2Q00977 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Gjb2Q00977 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Gjb2Q00977 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms